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汇像猴痘病毒自动化检测解决方案 | 浅谈猴痘病毒的实验室检测

发布时间: 2022-06-02 20:21 来源:上海汇像信息技术有限公司

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截至5月26日,累计 23 个未流行猴痘病毒国家向世卫组织报告实验室确诊病例257例,疑似病例约120例,没有死亡报告。流行病学调查正在进行中,绝大多数报告的猴痘确诊病例都无流行地区旅居史,猴痘确诊和疑似病例的识别是非典型的。


猴痘病毒实验室检测

的意义


目前,世界多个地区爆发了多国猴痘疫情,波及范围尚不明确。在这种情况下,开展实验室检测的意义在于能够及时地确认已感染病例,尽早打破传播链,阻止疫情爆发。


实验室检测方法有哪些?


  • 荧光定量PCR(qPCR)

  • NGS二代测序

  • ELISA

汇像三种检测方案

快速锁定确诊者,确定病毒进化枝


1

高通量核酸检测自动化解决方案


根据《世界卫生组织猴痘病毒实验室检测指南》,一般使用qPCR或常规PCR等核酸扩增检测方法 (NAAT)对猴痘感染的疑似病例样本进行实验室检测。核酸检测的结果一般显示为正痘病毒 (OPXV) 或猴痘病毒(MPXV)的特定序列。


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同时,指南建议,因其传染性,对来自实验室中疑似、可能或确诊猴痘病例的标本进行所有处理,要采取控制风险的措施。自动化的检测方案能够降低实验员接触病毒的可能性,保护疫情环境下尤显珍贵的医疗检测资源。


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汇像方案


可适配市面上普通的核酸提取试剂盒和目前已获欧盟CE认证的“猴痘病毒核酸检测试剂盒”等。


猴痘病毒的提取和检测全流程


汇像也有自主研发的相关仪器,可与自动化系统无缝连接:

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应用案例


在新冠病毒横行期间,汇像高通量核酸检测自动化解决方案助力大规模核酸筛查,降低疾控人员及医护人员的工作强度和压力,实现单样日检测量万人份的需求,同时可兼容混样检测(5:1,10:1,20:1)等。

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高通量核酸检测自动化解决方案:Harmony G10000


Harmony G10000


1.全流程自动化,高通量检测无忧

    

   从样本核酸提取、PCR体系构建到qPCR检测全流程自动化


2.信息智能化:

   

   汇像Superlab中控系统的支持,对接样本信息,智能反馈检测结果

    开发了汇像核酸检测自动化数据对接系统,协助检测人员处理每日百万、  别的核酸数据


3.设置多重防护:


    紫外消毒和HEAP高效过滤,有效保护人工与样本安全


4.配置灵活开放:


    可与市面上常见耗材、试剂盒、检测仪器兼容



2

NGS二代测序自动化解决方案


指南提到,除了 NAAT,测序方法能够确定病毒进化枝、了解流行病学。因此WHO强烈鼓励各国在可用和可公开访问的数据库中共享 MPXV 基因序列数据。


荧光定量PCR的核酸检测对于猴痘病毒的大规模筛查以及确诊判定,有巨大优势,但也存在一些缺点:


在病毒感染的期,需对病毒的全基因组序列进行全部解码,解码完成方可应用qPCR进行筛查工作;

后期病毒在传染过程中,开始出现新变异,此时基于荧光定量PCR的筛查可能就会存在漏检的情况。


因此在进行猴痘病毒检测的过程中,对于猴痘病毒的全基因组检测至关重要。


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mNGS检测流程图

(图片来自卫健委临床检验中心副主任李金明 报告)


近些年,随着二代测序在肿瘤诊断,无创基因筛查方面的大放异彩,其在致病性微生物感染领域,也逐渐开始发挥出了巨大的作用,尤其在解析未知感染、快速解析微生物全基因组、检测变异毒株等方面,有着荧光定量PCR技术不可达到的技术优势。


应用案例


近期猴痘病毒感染在欧洲的肆虐,基于宏基因组的NGSmNGS)具有着广阔应用前景:

 

  • 快速解码猴痘病毒的全基因序列


  • 可随时且快速的对猴痘病毒的变异情况进行适时追踪,了对猴痘病毒变异株的检测时效


  • mNGS在鉴别诊断方面,也具有巨大优势:

      对猴痘病毒以及其他病毒的感染进行鉴别诊断;

      解码每个个体猴痘病毒的全基因组序列,进而实现对猴痘病毒进行适时的追踪溯源,为随后疫情的防控提供技术指导等。

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汇像mNGS自动化解决方案


3

高通量ELISA自动化工作站


ELISA:enzyme linked immunosorbent assay,也称酶联免疫吸附测定,指将可溶性的抗原或抗体结合到聚苯乙烯等固相载体上,利用抗原抗体特异性结合进行免疫反应的定性和定量检测方法。近期国内已有多家用ELISA的方法检测猴痘病毒的特异性抗原与抗体的试剂盒,申请并通过了欧盟的CE认证。


应用案例


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汇像高通量ELISA自动化工作站


高效安全:

精准快速加样,避免交叉污染,提升效率



自动化:

实现96孔板高通量Elisa样本自动加样、梯度稀释、洗板和酶标检测



虽然目前世界卫生组织使用qPCR或普通PCR的方法进行猴痘病毒的诊断,但ELISA依然被认为是作为检测或者筛查猴痘病毒的补充诊断手段之一。


● ●


在防控疫情过程中,对猴痘病毒的及时有效检测至关重要。汇像拥有高通量核酸检测、NGS二代测序和高通量ELISA等检测方法的自动化工作方案,能够快速锁定确诊者,确定病毒进化枝,控制疫情,为大家的生命安全保驾护航。


参考资料:

1 《中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T 2097-2008》

《WHO-MPX-Laboratory-2022》


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