人工智能搜索引擎 CHIMERYS 助力快速、深度蛋白组覆盖

全新的智能搜索引擎CHIMERYS™，是赛默飞与蛋白质组学人工

智能领域的领导者MSAID™的合作成果，是全新一代为解析混合

谱而生的人工智能算法。这种革命性的算法可以大大提升DDA

数据中被识别的PSM数量，从而实现鉴定数目性能上的巨大飞

跃。CHIMERYS 基于 INFERYS 算法[1]构建，其中 INFERYS 使用深

度学习模型预测肽段的 MS/MS 谱图，CHIMERYS 进一步尝试解

释 MS/MS 谱图中的每一个峰。因此，可以有效进行混合谱图的解

析。

CHIMERYS搜索引擎目前可支持的工作流程包括肽段和蛋白的鉴

定、非标记定量（LFQ）、TMT标记定量，不仅可改善鉴定蛋白

质的数量，还可提高定量性能。本文使用 Hela 标准肽段，在不同

分析梯度和样品通量，包括8min到60min的5个不同梯度分别进行

DDA数据采集，对比 SequestHT 和 CHIMERYS 搜库结果，在不同

梯度下，CHIMERYS

均有不同程度的提升，其中梯度越短，谱图

越复杂，提升比例越高，表明 CHIMERYS 适合复杂谱图的解析。

在使用 CHIMERYS 后，180SPD通量可获得原来 60SPD 使用 Se-

questHT时一致的蛋白和肽段鉴定，提示我们在后续使用CHIME-

RYS进行数据解析可有效提高样品分析通量。另外，本文中也对

CHIMERYS搜索结果的可信程度进行了讨论。