全新一代Vanquish Neo UHPLC 液相色谱在nanoLC-MS/MS 蛋白质组学分析中的应用

蛋白质组学研究是系统式鉴定、定量蛋白质，并全景式研究蛋白质

功能的学科。随着学科的进步，对于自下而上（Bottom-up）蛋白

质组学的分析深度的需求不断增加。蛋白质组学的分析深度可显著

影响人们对于生理、病理过程的理解，以及影响早期诊断的生物标

志物的发现等领域，而随着精准医学等应用方向的研究不断深化，

则需要更高灵敏度更高分辨率的分析手段。在蛋白质组学的发展历

程中，基于毛细管色谱柱的纳升液相联合高分辨质谱的成功应用，

使得蛋白质组学研究以超高的灵敏度、极小的上样量为其特点而著

称，可在质谱端获得几千甚至上万蛋白的鉴定深度。这些优异性能

也极大的拓宽了蛋白质组学技术在生命科学领域的应用范围。

在反相液相色谱的分析中，为实现对较低丰度多肽的鉴定，通常需

要使用更长的色谱柱以提供更高的色谱峰容量，而较长的色谱柱也

对于色谱耐受压力提出了更高的要求[1-2]。

本文我们以全新一代可耐压1500 bar的Vanquish Neo UHPLC 液相

色谱搭载Orbitrap Exploris 480高分辨质谱仪，测试了不同长度的色

谱柱在不同梯度内对Hela细胞裂解液的鉴定能力，同时也考察了全

新的FAIMS Pro Duo在此色谱-质谱组合中的鉴定提升能力。