NGS-ctDNA 给肿瘤精准医疗带来新希望

1948 年，Mandel 和 Metais 首次发现人体血液中存在着游离形式的 DNA。所有游离在血液中的 DNA 统称为 cfDNA(cell-free DNA)，而来自肿瘤细胞的 cfDNA 就是 ctDNA。

ctDNA（circulatingtumorDNA），又名循环肿瘤 DNA，主要有三种来源：坏死的肿瘤细胞、凋亡的肿瘤细胞以及肿瘤细胞的外泌体。ctDNA 以核小体为载体，以单个、双联或者三联的形式进入血液。同时有研究显示 ctDNA 的半衰期只有 2 个小时，因此可以更精确的反应肿瘤的情况。

随着科学发展，ctDNA 检测已成为当前肿瘤领域的诊疗新热点。由于 ctDNA 的质量和数量变化大，且半衰期短，因此需要高特异性和高灵敏度的检测方法。目前常用的检测方法主要有微滴式数字 PCR(ddPCR)，扩增阻滞突变 PCR(ARMS PCR) 和二代测序 (NGS) 等。不同的方法原理不同，灵敏度不同，一次可检测的基因个数和位点也不同。

ctDNA 在血液中含量较低，一般只有 cfDNA（游离血浆 DNA）的 0.01%-1%，因此它的捕获测序一直是一个技术难题。新一代基因测序（NGS）有助于血浆 ctDNA 的检测，可在复发或病情恶化前进行早期预测，借力于 NGS 的发展，目前可以对捕获到的 ctDNA 进行超深度测序，捕获低频突变，全面抓取 ctDNA 的相关信息。并且以 ctDNA－NGS 为基础的分析方法可通过得知新兴突变片段而决策一个新的治疗方案。

基于 NGS 技术的检测方法灵敏度高，能同时检测多个基因的多种变异。但是 ctDNA 样品浓度不均一，在正常人和特殊肿瘤中的浓度较低，且半衰期短，在上测序仪前的质控就显得尤为关键。

厚泽生物推出的 Qsep 系列全自动核酸蛋白分析系统，无需制胶、染色、加样、拍照等步骤，也不需要荧光标记，1-96 个样本灵活上样，只需将待检测样品放入仪器样品盘，全自动上样出结果，操作简便，分辨率高（可达 1-4bp），结果以数字峰形图和模拟凝胶图呈现，可导出 PDF、Eexcel、Word 等多种报告格式。可检测浓度低达 2pg/ul 的 ct DNA 样本（图 1），后续还可对文库进行质控，检测片段大小（图 2），检测接头残留（图 3），为测序质量把关。


图 1


图 2


图 3