1月新发客户文献——本期热点『肠道稳态/血管修复/肿瘤/自噬』

2023年，使用吉凯基因的产品/服务发表的文献300+篇。历年累计20000+篇！

此次小编精心挑选了12篇1月新发的高质量文章供大家欣赏，希望在2023年给您的科研计划提供一些思路和灵感，快来一睹为快吧！

2022往期回顾

7月新发客户文献——本期热点『免疫应答/外泌体/肿瘤/损伤』

8月新发客户文献——本期热点『肿瘤/基因治疗/自噬/免疫』

9月新发客户文献——本期热点『肿瘤/脑损伤/糖尿病/免疫』

10月新发客户文献——本期热点『肿瘤/损伤/细胞癌/自噬』

11月新发客户文献——本期热点『损伤/稳态/肿瘤/凋亡』

12月新发客户文献——本期热点『肝纤维化/损伤/免疫逃逸/肿瘤』

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TRIM27通过促进肠道干细胞自我更新来维持肠道稳态

TRIM27 maintains gut homeostasis by promoting intestinal stem cell self-renewal

发表期刊：Cellular & Molecular Immunology  IF: 22.096

发表单位：中国科学院微生物与免疫学重点实验室

吉凯助力：Trim27过表达慢病毒

文章摘要：肠道稳态失调与肠易激综合征（IBS）有关，这是一种影响全球约11.2%人口的慢性功能性胃肠道疾病。IBS的发病机制尚不清楚，阻碍了其治疗。在这里，作者报道了E3泛素连接酶三方基序27（TRIM27）在IBS中弱表达，但在炎症性肠病（IBD）中高表达，IBD是一种常见的慢性有机性胃肠道疾病。因此，在小鼠中敲除Trim27会导致自发出现的IBS样症状，包括内脏痛觉过敏增加和异常大便特征，如IBS患者中观察到的。从机制上讲，TRIM27稳定β-连环蛋白，从而激活Wnt/β-连环素信号，促进肠干细胞（ISC）自我更新。与这些发现一致，Trim27缺乏症会破坏类器官的形成，通过重新引入Trim27或β-。此外，Wnt/β-catenin信号激活剂治疗通过促进ISC自我更新改善IBS症状。总之，这些数据表明TRIM27对于维持肠道稳态至关重要，这表明靶向TRIM27/Wnt/β-catenin轴可能是IBS的潜在治疗策略。这些研究表明，TRIM27可能是区分IBS和IBD的潜在生物标志物。

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FTO依赖的m6A修饰Plpp3在circscmh1调控的卒中后血管修复和功能恢复中的作用

FTO-dependent m6A modification of Plpp3 in circSCMH1- regulated vascular repair and functional recovery following stroke

发表期刊：Nature Communications IF: 17.694

发表单位：东南大学医学院 江苏省重症医学重点实验室药理学系

吉凯助力：FTO/YTHDF1/circSCMH1 干扰慢病毒   FTO 过表达腺相关病毒

文章摘要：血管修复被认为是改善缺血性卒中后长期预后的关键恢复措施。N6甲基腺苷（m6A）是真核mRNA中最常见的内部修饰，在功能上介导血管修复。然而，环状RNA SCMH1（circSCMH1）是否通过中风后m6A甲基化促进血管修复仍有待阐明。在这里，作者确定了circSCMH1在促进光血栓（PT）卒中后雄性小鼠和雄性猴子梗死周围皮质的血管修复以及减弱PT卒中后雄性鼠梗死周围皮质缺血诱导的m6A甲基化中的作用。从机制上讲，circSCMH1增加了泛素化修饰的脂肪团和肥胖相关蛋白（FTO）向内皮细胞（EC）细胞核的易位，导致磷脂磷酸酶3（Plp3）mRNA的m6A去甲基化，随后增加了内皮细胞中Plp3的表达。实验数据表明，circSCMH1在中风后通过FTO调节的m6A甲基化增强血管修复，为circSCMH1促进中风恢复的机制提供了见解。

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BCAT2形成非炎症肿瘤微环境，并通过负性调节促炎性趋化因子和抗癌免疫诱导对抗PD-1/PD-L1免疫疗法的抵抗

BCAT2 Shapes a Noninflamed Tumor Microenvironment and Induces Resistance to Anti-PD-1/PD-L1 Immunotherapy by Negatively Regulating Proinflammatory Chemokines and Anticancer Immunity

发表期刊：Advanced Science IF: 17.521

发表单位：中南大学湘雅医院泌尿外科

吉凯助力：BCAT2 GV341 过表达慢病毒   BCAT2 GV112 干扰慢病毒

文章摘要：为了提高免疫检查点阻断（ICB）单一疗法的应答率，有必要在联合疗法中寻找新的靶点。通过对肿瘤微环境（TME）相关指标的分析，证实BCAT2在癌症中形成无火焰TME。多组学结果表明，BCAT2通过抑制促炎细胞因子/趋化因子相关通路和T细胞趋化通路的活性，对细胞毒性淋巴细胞募集具有抑制作用。免疫测定显示，CD8+T细胞相关趋化因子的分泌与BCAT2保持强烈的负相关，从而导致BCAT2+肿瘤细胞周围CD8+T淋巴细胞从远到近的减少趋势。BCAT2缺乏症和抗PD-1抗体的联合治疗在体内具有协同作用，暗示BCAT2在联合治疗中的潜力。此外，BCAT2在预测免疫疗法疗效方面的价值在多个免疫疗法队列中得到验证。总之，作为TME中的关键分子，BCAT2是与ICB结合的新兴靶点，也是指导精确治疗的生物标志物。

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MCU上调通过促进镉肝毒性中的VDAC1二聚化和泛素化而过度激活线粒体吞噬

MCU Upregulation Overactivates Mitophagy by Promoting VDAC1 Dimerization and Ubiquitination in the Hepatotoxicity of Cadmium

发表期刊：Advanced Science IF: 17.521

发表单位：重庆市职业病与中毒防治重点实验室

吉凯助力：MCU/CREB/CypD/VDAC1/ATG5/PINK1/ATP5G1/ANT2/Parkin 干扰质粒

文章摘要：镉（Cd）是一种肝病的肝病致病性毒素。过度的线粒体吞噬是镉诱导的肝毒性的一个标志。然而，其潜在的机制仍然不清楚。线粒体钙单转运体（MCU）是线粒体和细胞内稳态的关键调控因子。这里发现，Cd暴露上调MCU表达，线粒体Ca2+摄取增加。通过siRNA或Ru360抑制MCU可显著减弱cd诱导的过度线粒体吞噬，从而挽救线粒体功能障碍，增加肝细胞活力。杂合子MCU基因敲除小鼠在Cd暴露后表现出肝功能改善，病理损伤改善，线粒体碎片减少，线粒体吞噬减少。在机制上，Cd通过磷酸化激活cer响应元件结合蛋白S33（CREBS133）上调MCU的表达，随后结合MCU启动子在区域、ACGTCA和区域上调MCU的表达，导致MCU基因转录增加。上调的MCU与电压依赖的阴离子选择性通道蛋白1（VDAC1）强烈相互作用，增强其二聚化和泛素化，导致线粒体过度吞噬。本研究揭示了Cd上调MCU增强线粒体吞噬和肝毒性的新机制。

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RanGAP1的缺失导致染色体不稳定和骨肉瘤的快速肿瘤发生

Loss of RanGAP1 drives chromosome instability and rapid tumorigenesis of osteosarcoma

发表期刊：Developmental Cell IF: 13.417

发表单位：南方医科大学基础医学系 细胞生物学系骨和关节变性疾病重点实验室

吉凯助力：HANBIO 干扰慢病毒

文章摘要：染色体三联体是一种染色体不稳定的灾难性事件，涉及局部染色体区域内的密集断裂和重排。然而，其原因仍不清楚。在这里，作者表明，Ran GTPase激活蛋白1（RanGAP1）的减少和失活通常发生在人类骨肉瘤中，这与高比率的色三联体有关。在快速扩张的小鼠骨祖细胞中，RanGAP1缺陷会导致chr1q中的三联体、Rb1的瞬时失活和p53的降解、DNA损伤修复的失败以及超快的骨肉瘤发生。在有丝分裂过程中，RanGAP1锚定到动粒，在那里它招募PP1-γ以抵消纺锤体组装检查点（SAC）的活性，并防止TOP2A降解，从而保护染色单体脱链。RanGAP1的缺失导致SAC过度激活和染色单体脱链失败。这些发现表明，RanGAP1保持有丝分裂染色体的完整性，并且RanGAP1的缺失通过其对SAC的直接影响和对DNA损伤监测的连锁和次级影响来驱动肿瘤发生。

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来自血管内皮细胞的PTX3导致曲妥珠单抗诱导的心脏并发症

PTX3 from vascular endothelial cells contributes to trastuzumab-induced cardiac complications

发表期刊：Cardiovascular Research IF: 13.081

发表单位：浙江大学药学院药物安全评价研究中心

吉凯助力：PTX3 过表达慢病毒

文章摘要：曲妥珠单抗是第一种靶向人表皮生长因子受体2（ERBB2/HER2）的人源化单克隆抗体，目前被用作HER2（+）肿瘤的一线治疗。然而，曲妥珠单抗在不影响心肌结构的情况下增加了心脏并发症的风险，这表明了一种独特的心脏毒性机制。作者使用曲妥珠单抗处理的人脐静脉内皮细胞（HUVECs）培养基处理CCC-HEH-2细胞、人胚胎心脏组织衍生细胞系和人诱导多能干细胞衍生心肌细胞（iPSC CM），以评估血管内皮细胞（VECs）和心肌细胞之间的串扰。蛋白质质谱分析用于确定VEC中调节心肌细胞功能的关键因素。RNA测序来阐明PTX3导致心脏功能障碍的机制。使用抗人/大鼠HER2（neu）单克隆抗体生成大鼠模型，该模型用于评估曲妥珠单抗对心脏结构和功能的影响，以及拉帕替尼对曲妥珠的心脏副作用的抢救作用。来自曲妥珠单抗处理的HUVEC的培养基明显损害了CCC-HEH-2细胞和iPSC CM的收缩力。来自VEC的PTX3导致小鼠的心肌细胞收缩力缺陷和心脏功能不全，复制曲妥珠单抗治疗。PTX3影响心肌细胞的钙平衡，导致收缩财产缺陷。VEC中的EGFR/STAT3信号传导有助于PTX3的表达和释放增加。值得注意的是，拉帕替尼，一种EGFR/HER2的双重抑制剂，可以通过阻断PTX3的释放来挽救曲妥珠单抗引起的心脏并发症。研究确定了一种独特的心脏毒性模式，其中曲妥珠单抗在VEC中激活EGFR/STAT3信号促进PTX3排泄，这通过抑制细胞钙信号导致心肌细胞收缩力受损。拉帕替尼可能是一种可行的预防曲妥珠单抗诱导的心脏并发症的药物，并为拉帕替尼和曲妥珠单抗联合应用于癌症治疗提供了理论基础。

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下调Linc00173通过miR-1275/PROCA1/ZFP36L2轴增加BCL2 mRNA的稳定性，并诱导肺腺癌获得性顺铂耐药

Downregulation of Linc00173 increases BCL2 mRNA stability via the miR-1275/PROCA1/ZFP36L2 axis and induces acquired cisplatin resistance of lung adenocarcinoma

发表期刊：Journal of Experimental & Clinical Cancer Research   IF: 12.658

发表单位：广东省蛋白质修饰和降解重点实验室

吉凯助力：LINC00173 GV146 过表达质粒 LINC00173 GV248 干扰慢病毒

文章摘要：LINC00173已被报道为顺铂（顺式二胺二氯铂，DDP）化疗耐药诱导剂，用于小细胞肺癌（小小细胞肺癌）和肺鳞状细胞癌（LUSC）。本研究旨在展示LINC00173作为肺腺癌（LUAD）中DDP化疗敏感性诱导因子的反向数据。DDP耐药LUAD患者LINC00173下调与预后不良相关。此外，LINC00173在DDP耐药的LUAD细胞和DDP处理的人LUAD组织中的表达显著降低。抑制LUAD细胞中LINC00173的表达增强了体内和体外DDP的耐药性，而恢复了DDP耐药LUAD细胞的LINC00173表达则显著恢复了对DDP的化疗敏感性。机制上，DDP耐药的LUAD细胞激活PI3K/AKT信号，并进一步提高c-Myc表达。c-Myc作为一种致癌转录因子，与LINC00173的启动子结合并抑制其表达。LINC00173表达的减少减弱了致癌miR-1275的吸附，下调了miR-1275靶基因PROCA1的表达。PROCA1通过招募ZFP36L2与BCL2的3′非翻译区结合，降低BCL2 mRNA的稳定性，从而激活凋亡信号，从而发挥潜在的肿瘤抑制作用，诱导细胞凋亡和DDP药物敏感性。本研究证明了LINC00173的一个新颖的关键作用。在LUAD中，DDP激活的PI3K/AKT/c-Myc信号被转录抑制，通过调节miR-1275抑制DDP获得的化疗耐药性，抑制PROCA1/zfp36l2诱导的BCL2降解，从而导致凋亡信号减少。这些数据与之前描述的LINC00173在SCLC或LUSC中的作用不一致，这表明LINC00173可以在不同的肺癌病理亚型中发挥微调的DDP耐药作用。本研究表明，LINC00173基因表达量的减少可能是LUAD中DDP获得性耐药性的一个指标。

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LARP6通过ZNF267/SGMS2介导的鞘磷脂合成失衡抑制结直肠癌癌症进展

LARP6 suppresses colorectal cancer progression through ZNF267/SGMS2-mediated imbalance of sphingomyelin synthesis

发表期刊：Journal of Experimental & Clinical Cancer Research   IF: 12.658

发表单位：南方医科大学南方医院病理科

吉凯助力：LARP6 过表达慢病毒

文章摘要：结直肠癌（CRC）随着结直肠癌发病率和死亡率的增加，严重危害人类健康。LARP6是la相关蛋白（LARP）家族的成员，是一种RNA结合蛋白，可能与结直肠癌的进展有关，但其在结直肠癌中的具体作用和机制尚不清楚。在本研究中，作者发现LARP6在CRC中表达下调，并与患者的总生存期和无复发生存期相关。此外，LARP6表达的改变会影响CRC细胞的侵袭和转移。在机制上，发现LARP6结合ZNF267 mRNA，并调节其稳定性和翻译。LARP6抑制了ZNF267下游靶点SGMS2的表达，导致CRC细胞中神经酰胺和鞘磷脂失衡。有趣的是，LARP6也增强了CRC细胞的自噬活性，而且这种作用至少部分取决于抑制sgms2介导的鞘磷脂合成。研究显示了LARP6/ZNF267/SGMS2轴如何影响结直肠癌的进展，这有助于进一步了解结直肠癌发展的分子机制。

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肌凝蛋白轻链4基因转移可减轻心房纤维化，同时纠正自噬通量失调

Myosin light-chain 4 gene-transfer attenuates atrial fibrosis while correcting autophagic flux dysregulation

发表期刊：Redox Biology IF: 10.787

发表单位：上海第十人民医院心内科

吉凯助力：MYL4 过表达腺病毒

文章摘要：作者之前已经证明了心房特异性的必需轻链蛋白MYL4是心房收缩、电性和结构完整性所必需的。MYL4突变/功能障碍会导致心房纤维化、停滞和心律失常。然而，其潜在的致病机制尚不清楚。致病性MYL4突变体MYL4敲入(p.E11K)发展为纤维化性心房心肌病。蛋白质组分析和单细胞RNA测序表明，突变型myl4心房功能障碍中自噬通路的富集。免疫荧光和电镜显示，MYL4p中积累了未降解的自噬囊泡。E11K大鼠心房。接下来，作者发现功能失调的MYL4蛋白在体内和体内损害自噬通量。心肌细胞中心脏溶酶体的定位和迁移受到MYL4的调节，这影响了溶酶体的酸化和溶酶体组织蛋白酶的成熟。然后检测了通过腺病毒基因转移导致的MYL4过表达对MYL4突变诱导的心房心肌病的影响：MYL4蛋白过表达减轻了心房结构重构和自噬功能障碍。MYL4通过溶酶体迁移调节心房心肌细胞的自噬通量。MYL4过表达可减弱MYL4 p.E11K诱导纤维化性心房心肌病，同时纠正自噬和溶酶体功能。这些结果为myl4突变体诱导的纤维化性心房心肌病提供了分子基础，并为心房纤维化的治疗提供了一种潜在的生物治疗方法。

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组蛋白甲基转移酶KMT2B通过上调EGF的表达来促进宫颈癌的转移和血管生成

Histone Methyltransferase KMT2B Promotes Metastasis and Angiogenesis of Cervical Cancer by Upregulating EGF Expression

发表期刊：International Journal of Biological Sciences  IF: 10.75

发表单位：上海交通大学医学院仁济医院肿瘤研究所

吉凯助力：luciferase 过表达慢病毒

文章摘要：有证据表明，赖氨酸甲基转移酶2B（KMT2B）是一种主要的H3K4三甲基转移酶（H3K4me3），有助于多种癌症的发展；然而，它在宫颈癌（CC）中的作用尚不清楚。在本研究中，在人类CC标本中观察到KMT2B表达增加，并与不良预后显著相关。过表达kmt2b细胞的条件培养基促进了体外血管生成。在人CC的皮下模型中，过表达KMT2B可显著促进肿瘤生长，增加肿瘤血管密度。同时，在尾静脉转移模型中，KMT2B增强了CC细胞的迁移和侵袭，促进了其向骨的转移。在机制上，KMT2B上调的基因在PI3K-AKT通路中显著富集。通过对H3K4me3 ChIP-seq的分析，作者发现在过表达kmt2b的HeLa细胞中，EGF启动子区H3K4me3水平升高。ChIP-qPCR实验不仅证实了EGF启动子H3K4me3水平的升高，而且还确定了在过表达KMT2B的HeLa细胞中，KMT2B增加了与EGF启动子的结合。阻断EGFR可减少kmt2b诱导的PI3K-AKT信号通路的激活和CC细胞的迁移和侵袭。此外，EGFR抑制剂消除了HUVECs的kmt2b驱动的管形成能力。综上所述，KMT2B通过上调EGF的表达来促进CC的转移和血管生成，并可能成为CC新的治疗靶点。

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BGN/FAP/STAT3正反馈回路介导的肿瘤细胞与间皮细胞的相互作用导致胃癌腹膜转移

BGN/FAP/STAT3 positive feedback loop mediated mutual interaction between tumor cells and mesothelial cells contributes to peritoneal metastasis of gastric cancer

发表期刊：International Journal of Biological Sciences   IF: 10.75

发表单位：武汉大学中南医院胃肠外科

吉凯助力：BGN 过表达/干扰慢病毒

文章摘要：腹膜转移（PM）在胃癌（GC）中最为常见，而肿瘤相关成纤维细胞（CAFs）在这一过程中起着关键作用。然而，胃癌PM中CAFs与癌细胞之间串扰的具体机制尚不清楚。对GC病灶和PM病变进行芯片测序，并筛选大聚糖（BGN）进行进一步研究。临床上，BGN在胃癌组织中的表达高于癌旁正常组织，且高表达与不良预后相关。体外实验表明，BGN促进了肿瘤的进展和间皮细胞（MCs）向肿瘤相关成纤维细胞样细胞（CAFLCs）的转化。反过来，caflcs来源的成纤维细胞活化蛋白（FAP）促进了GC细胞的增殖、迁移、侵袭和上皮-间充质转化（EMT）。通过回收实验、共免疫沉淀实验、核和细胞质蛋白提取实验，结合TLR2)/TLR4激活NF-κB通路，促进MCs向CAFLCs转化。caflcs衍生的FAP可以激活GC中的JAK2/STAT3信号通路。最后，激活的STAT3促进了GC中BGN的转录，形成了一个BGN/FAP-STAT3的正反馈回路。综上所述，肿瘤细胞与BGN/FAP-STAT3正反馈回路介导的激活的MCs相互作用，促进了胃癌的PM，为胃癌转移提供了潜在的生物标志物和治疗靶点。

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HER2的类泛素化可抑制其蛋白降解并促进乳腺癌的进展

Neddylation of HER2 Inhibits its Protein Degradation and promotes Breast Cancer Progression

发表期刊：International Journal of Biological Sciences   IF: 10.75

发表单位：广州医科大学附属肿瘤医院

吉凯助力：HER2/NEDD8 过表达质粒

文章摘要：HER2是一种具有内在酪氨酸激酶活性的跨膜受体，在近25%的人类乳腺癌中过表达。在这里，作者报道了HER2的类泛素化是一种新的翻译后修饰，它控制着其在人类乳腺癌中的表达和致癌活性。在人类乳腺标本中检测到类泛素化途径中的两个关键成员，NEDD8和NEDD8激活酶E1亚基1（NAE1）。过表达NEDD8和NAE1与人乳腺癌中HER2的表达呈正相关。随后的结构和功能实验表明，HER2直接与NEDD8和NAE1相互作用，而该蛋白的表达因HER2的缺失而降低。在机制上，类泛素化抑制通过改善HER2蛋白的泛素化来促进其降解。HER2过表达消除了类泛素化消耗引发的细胞生长抑制。与曲妥珠单抗协同抑制类泛素化可显著抑制HER2阳性乳腺癌的生长。总的来说，这项研究证明了之前未发现的nedd8依赖的HER2类泛素化促进乳腺癌肿瘤生长的作用。

1.实验技术干货

2.蛋白质组学研究

3.腺病毒简介及应用

4.临床基础研究思路解析    

5.组织特异性腺相关病毒

6.单细胞测序    

7.慢病毒实验操作指南

8.悬浮细胞专用病毒

9.靶点设计/数据库教程

10.测序技术研究与应用

11.非编码RNA研究技术与应用

12.腺相关病毒选择/应用    

13.表观遗传研究

14.文章解析

15.国自然课题设计思路解析

16.生物信息分析及工具      

17.外泌体研究    

18.肿瘤免疫研究

19.高分文章  

20.吉凯病毒神经方向应用案例