宏基因组测序

一、服务介绍

宏基因组学研究不要求对每个微生物进行分离纯化培养，而是直接从样品中提取基因组DNA后进行测序分析。通过宏基因组测序，能够解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系，地扩展了微生物学研究范围。环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物16S rDNA高变区/ITS 的PCR扩增产物进行高通量测序，分析该环境下微生物群落的多样性和分布规律。

二、分析项目

标准分析项目

1. 去除宿主污染，产出数据及质控统计

2. 组装前，通过K-mer分析评估样品的测序深度

3. 序列组装

4. 基因组结构注释（串联重复序列注释、短回文重复序列注释、可变遗传因子注释、基因编码区域预测、NCBI NR库比对、致病岛预测、前噬菌体预测、毒力因子预测，可选）

5.基因功能注释（GO功能注释，KEGG通路注释，Swissprot数据库注释、COG功能分类）

6.比较基因组分析（基因家族分析，系统进化树构建，物种分期时间预测）

7. 生物种类和丰度估计

8. 样本间群落结构比较（多样本）；

9. 微生物生物分布与环境关联分析（多样本）；

上等分析项目

重要结论的获得;

聚类分析；

主成分分析；

通路富集分析；

功能富集分析；

个性化分析

宏基因组测序信息由基尔顿生物科技（上海）有限公司为您提供，如您想了解更多关于宏基因组测序报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途