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参考报价: | 1 RMB(人民币) | 型号: | RNA 甲基化课题设计思路 |
品牌: | 英拜生物 | 产地: | 上海 |
关注度: | 13 | 信息完整度: | |
样本: | 典型用户: | 暂无 |
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RNA 甲 基 化 修 饰 约 占 所 有 RNA 修 饰 的 60% 以 上 , 而 N6- 甲 基 腺 嘌 呤 (N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和lncRNAs上最为普遍的修饰。目前发 现microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有发生m6A修饰。 m6A修饰主要发 生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“编码器(Writer)”、“消码器(Eraser)”和“读码 器(Reader)”决定[1]。“编码器(Writer)”即甲基转移酶,目前已知这个复合物的成分有 METTL3,METTL14, WTAP和KIAA1429;而ALKBH5 和FTO作为去甲基酶(消码器)可 逆转甲基化;m6A由m6A结合蛋白识别,目前发现m6A结合蛋白(读码器)有YTH结构域 蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3, YTHDC1 和YTHDC2)和核不均一蛋白HNRNP 家族(HNRNPA2B1 和 HNRNPC)。
m6A 的研究方向 (1) 主要是通过研究 m6A 修饰相关的甲基化、去甲基化酶和识别蛋白的功能,进而研 究 m6A 修饰的生物学功能和作用机制:一般通过敲除 m6A 酶分子,研究下游功能 基因分子的表达和 m6A 甲基化情况,通过介导相关基因异常(可变剪切、稳定性、 翻译、miRNA 调控)影响细胞表型和功能特征。 (2) m6A 修饰图谱构建及作用机制:通过 m6A 甲基化测序(MeRIP-Seq,miCLIP)构 建疾病细胞模型或者发病组织的 m6A 修饰谱,分析 m6A 的 motif,peaks 数量及 分布,Peak 关联基因的特征,联合 RNA-seq 研究 m6A 甲基化与表达的关系。
m6A研究思路
疾病样本vs正常样本 3vs3以上 MeRIP‐Seq RNA‐Seq m6A修饰图谱分析 m6A修饰差异基因分析 差异表达基因分析 差异表达基因关联分析 MeRIP‐PCR、qPCR验证
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