微卫星(STR/SSR)分型检测服务

STR介绍

    STR（短串联重复序列），又称为微卫星标记或SSR。一般有2-6bp的核心序列串联重复而成，构成了STR基因座的遗传多态性。

STR/SSR具有分布广泛均匀、多态性丰富、遵循孟德尔共显性遗传、信息量大、检测简便等优点，STR/SSR分型高效快捷，结果准确，是非常重要的遗传标记，在遗传制图、连锁性分析、亲子鉴定、疾病基因定位和物种多态性研究等领域有着广泛的应用。

上海翼和生物微卫星分型服务：

根据具体实验规模，提供两种检测平台，分别为：适合中低通量检测的多重荧光PCR STR/SSR分型服务和适合高通量的基于二代测序的Hi-STR分型服务。

多重荧光PCR的微卫星（STR/SSR）分型服务

上海翼和生物采用通用荧光引物方案，多重PCR扩增STR/SSR位点，利用ABI遗传分析仪对荧光标记DNA片段进行检测，利用分子量内标进行DNA片段长度计算，使得微卫星分型变得高效，快捷，结果更加精确可靠。

技术路线：

 

技术特点：

 

服务流程

A.微卫星（STR/SSR）分型引物筛选

   1)客户提供样本以及位点信息；

   2)翼和设计相关位点的扩增引物，并合成；

   3)预实验抽样小试，摸索并优化反应条件（包括退火温度，镁离子浓度等）；

   4)3730 XL测序仪电泳

   5)Genemapper分析，数据导出；

B.大规模分型实验

   1)大规模样本位点扩增；

   2)3730 XL测序仪电泳；

   3)Genemapper分析，数据导出；

   4)交付实验报告，包括实验材料，方法，引物序列等；

 

Hi-STR分型服务

Hi-STR结合多重PCR技术和高通量测序技术，对需要检测的位点设计特异性引物，在单管内进行多重PCR扩增，不同的样本以不同的Barcode引物区分。混合样本后，在Ion Proton/illumina Hiseq/illumina X10平台上，对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法，实现对STR位点的检测，与传统的凝胶电泳或毛细管电泳相比，可以直接根据序列，准确判断STR位点的重复次数。Hi-STR适用于核心重复区域3bp的微卫星位点，配合各类高通量测序仪，使得STR分型具有更准确、更灵敏的特点，二代高通量测序，可将上千样本和STR位点混合检测，使检测更加高效经济。

技术路线：

 

技术特点：

 

本方法适用于动物植物及人类的遗传图谱绘制、QTL定位、生物多样性、动植物SSR位点检测、群体遗传结构等诸多领域。

 

相关链接：

多重荧光PCR的微卫星（STR/SSR）分型服务：http://www.biowing.com.cn/news/1/7.html

Hi-STR（高通量STR）分型服务：http://www.biowing.com.cn/news/1/112.html

 

上海翼和应用生物技术有限公司
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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途