NSAM-07 比较基因组分析-同源基因分析

本方案将讨论物种同源序列以及进化过程中和在特定选择压力下的基因功能与进化问题。同源序列可分为两种：直系同源（orthology）和旁系同源（paralogy）。直系同源(orthologous)指的是不同物种之间的同源性，例如蛋白质的同源性，DNA序列的同源性。直系同源的序列因物种形成（speciation）而被区分开（separated）：若一个基因原先存在于某个物种，而该物种分化为了两个物种，那么新物种中的基因是直系同源的；旁系同源的序列因基因复制（geneduplication）而被区分开（separated）：若生物体中的某个基因被复制了，那么两个副本序列就是旁系同源的。直系同源的一对序列称为直系同源体（orthologs），旁系同源的一对序列称为旁系同源体（paralogs）。

首先，该方案将针对当前物种的直系或旁系同源基因进行分析。其次，并识别和讨论各自同源基因的Ka/Ks，分析基因功能的进化和选择压。有研究表明，通过比较基因组学分析后，物种特异的基因具有不同的选择压，并可以通过直系同源和旁系同源分析以及Ka/Ks计算来讨论。

图例 玉米与水稻基因组直系或旁系同源基因分析与比对结果 

 

图例 青鱼（Medaka）基因组与human基因组进化分歧计算。

根据识别的ortholog和paralog基因以及和SNP计算得到的同源基因的Ka/Ks。 

 

-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 

de novo 基因组测序

基因组从头测序（de novo sequencing）是不需要任何参考序列资料即可对某个物种进行测序，用生物信息学分析方法进行拼接、组装，从而获得该物种的基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术，可以获得动物、植物、细菌、真菌的全基因组序列，从而推进该物种的研究，为后续研究物种起源进化及特定环境适应性奠定基础。为该物种的后基因组学研究搭建一个高效的平台；为后续的基因挖掘、功能验证提供DNA序列信息。BioGenius利用新一代高通量测序技术(NGS)，并可联同单分子测序平台(Bionano)高效地完成所有物种的基因组序列图谱。

 



更多详情：http://www.biogenius.cn/htm/products/genomics/denovogenome/analysis/18.html


 

Big Data , Big Idea !    
惠研生物，提供领先的生物大数据解决方案！

• 全基因组测序/外显子组, 转录组等项目共计 完成近万个样本的测序与分析服务
• 累计协助客户发表权威SCI论文总IF超过 160分
• 512核心CPU，1T内存 满足大规模并行的，敏捷的数据分析服务;
• 1PB 数据磁盘阵列保证企业级 测序分析结果存储的安全稳定

官方网站：www.biogenius.cn 
咨询热线：400-016-9606 / 180-1908-2932 
官方微信： 微信公众平台搜索 “惠研生物”  
官方QQ： 1744353207 
咨询邮箱： service@biogenius.cn

NSAM-07 比较基因组分析信息由上海惠研生物科技有限公司为您提供，如您想了解更多关于NSAM-07 比较基因组分析报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途