App Pro-03 靶向蛋白组学

选择反应***技术(selected reaction monitoring，SRM)

在zei成熟的定向分析技术，也就是选择反应***技术(selected reaction monitoring，SRM)中，一种称为三重四极杆质谱仪(triple quadrupole)技术的质谱方法能检测到独一无二的特异性肽段，帮助研究人员高灵敏度，可重复性的定量监测这些蛋白。质谱方法比抗体方法更先进的原因是大大减少了检测特异性方面的问题(抗体方法存在交叉反应的问题。虽然抗体方法在低丰度蛋白的检测方面更加灵敏，但是质谱技术的一个明显优势就是能在单个实验中检测多种蛋白，比如说，系统生物学研究人员可以了解到一蛋白网络中蛋白水平的波动，或者临床研究人员能检测到某种疾病状态下，一组生物标记物的变化情况。 
 

SRM技术应用范围

检测代谢通路中蛋白丰度的动态改变趋势
 

蛋白复合体与亚体研究
 

信号通路***酸化事件测定
 

蛋白修饰cross-talk模式研究
 

生物标记物的鉴定
 

多反应监测（MRM, multiple reaction monitoring）技术

多反应监测技术是基于已知信息或假定信息设定质谱检测规则，对符合规则的离子进行信号记录，去除大量不符合规则离子信号的干扰，从而得到质谱信息的一种数据获取方式。指通过质谱技术—多反应监测（MRM）快速检测目标蛋白，具有灵敏度高、重复性好的特点。MRM分为“MRM方法建立”和“样本分析”两个过程。具体步骤详见下图和“技术流程”。 
 

技术特点

无需抗体：通过设计母子离子对（Transitions）实现目标蛋白筛选，无交叉反应，避免假阳性结果。

方法建立长期性：无需反复建立方法，每个蛋白transitions一次性建立，长期适用。

定量精确：以合成肽段或者同位素标记作为内标，可得到每个蛋白的绝对定量值，精确至pg级。

高通量：每run可检测多达20种蛋白。

重现性好：多重保障（每个肽段多个transitions，每个蛋白多个肽段，每个信号多次检测），自动化操 作，可在不同实验室间获得高重现性。

辨别蛋白亚型：依据蛋白亚型特异氨基酸序列设计transitions，区分不同亚型。 
 

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BioGenius具有蛋白质组数据丰富的分析处理经验。分析内容涉及：原始数据蛋白鉴定分析，蛋白修饰分析，蛋白质结构域分析，蛋白质相互作用分析，蛋白质结构建模分析，采用分子动力学模型预测蛋白-蛋白对接与蛋白-配体对接及其结合位点等。

蛋白质组是对蛋白质特别是其结构和功能的大规模研究。蛋白质组学比基因组学要复杂得多。基因组是相当稳定的实体，而蛋白质组通过与基因组的相互作用而不断发生着改变。一个生命体在其机体的不同部分以及生命周期的不同阶段，其蛋白表达可能存在巨大的差异。

常用的定量蛋白组学技术有：iTRAQ技术，LC-MS/MS技术等。

 

质谱平台

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