转录组+蛋白质组+代谢组联合分析

发布时间：2022年07月

· 产品定义

转录组学和蛋白质组学都是获得基因表达情况的重要工具，从生物学角度上看，转录组代表了基因表达的中间状态，可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理；而蛋白质是生物体直接的功能执行者，因而对其表达水平的研究有着不可替代的优势；代谢物与生理表型密切相关，常作为多组学系统研究的切入点。因此要全面探究生物体疾病机理、胁迫机制，精确研究重要基因的表达模式和调控机理，只有联合转录组学、蛋白组学和代谢组学数据对生物样本进行多维尺度研究，才能发掘生命过程中的分子调控机制，进而从整体上解释生物学问题。

· 技术优势

1. 更准确：弥补单一组学分析时，由于数据噪音、缺失等因素带来的数据问题

2. 更可靠：多组学数据资源之间可以进行相互验证，减少单一组学分析带来的假阳性

3. 更深入：多组学数据联合分析更有利于从不同层面、不同角度，系统解析生物学模型的多层次机制或机制表型的联系

· 数据分析

· 部分数据分析结果展示

· 推荐应用领域

生物领域各个研究方面，如：

1. 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；

2. 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等；

3. 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；

4. 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；

5. 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；

6. 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；

7. 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等；

8. 食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等。

· 项目案例

文献名称：Multiple omics study identifies an interspecies conserved driver for nonalcoholic steatohepatitis

发表期刊：《Science Translational Medicine》（IF=17.956）

合作单位：武汉大学

文章摘要：脂毒性是公认的非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的病理触发和加速因素。然而，脂毒性诱导的NASH的分子基础仍不清楚。本研究系统地绘制了多个物种的肝脏应对脂毒性损伤的转录组学图谱的变化。花生四烯酸途径保守和稳健激活，尤其是花生四烯酸12-脂氧合酶（ALOX12）基因的与人类、猕猴、猪和小鼠的NASH严重程度密切相关。通过对功能获得和丧失的研究，作者发现ALOX12在小鼠和巴马猪模型中都显著加剧了NASH。ALOX12通过溶酶体降解机制直接靶向乙酰辅酶a羧化酶1（ACC1）诱导NASH。总的来说，本研究揭示了NASH发病机制的关键分子驱动因素，并提示ALOX12-ACC1相互作用可能是NASH的治疗靶点。 

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