领域: | 蛋白/抗体/蛋白质组,核酸药物,细胞治疗 | ||
项目: | Mnova系列(二)Mgears:为数据分析构建自动化工作流程 |
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Mnova系列(二)Mgears:为数据分析构建自动化工作流程 |
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Mgears可以为数据(NMR、LC/MS及其他数据)分析构建自动化工作流程,以Mnova的软件特性和各种功能插件为基础,复制/创建标准操作程序,提高工作效率,规范数据处理、分析和报告的过程。
应用领域
ü 质量控制(核磁共振、质谱等)
ü 利用NMR进行天然产物的去重复化
ü 目标混合物分析
ü 蛋白质-配体相互作用
ü 确认产品ID
ü 结构验证
ü 反应监控
ü 定量核磁
ü DNA分析
ü Screening
Case 1:
对于核磁共振数据、质谱数据及其他类型的光谱数据来说,在实际应用的过程中,比如用于后续查阅、发表文章、申请专利时,需要对谱图数据进行一系列的处理分析以及排版,如图1。那么产生这样一份美观的多重峰分析报告需要哪些操作呢?具体流程包括:1.采集、获取原始数据;2.相位校正、基线校正;3.Peak picking;4.积分;5.多重峰分析;6.排版。
图1:多重峰分析报告
如果样本数量很多呢?比如一家公司每天可能都有成百上千个化合物需要产生这样的多重峰分析报告,那么上述流程就要进行成百上千次,显然这是重复且耗时的。有没有什么工具可以实现自动化操作?
Case 2:
某顶级的医药公司,研发中心主要分布在两所城市,每个研发中心有多台仪器,NMR、LC/MS等等,每年大约有十万个样品,化学家对数据进行处理分析以后可以保存到公司的数据库,后续可以通过样本名称、结构、特定的峰值位置等等对数据库中的数据进行检索,这样可以简化化学家们对分析数据的访问、数据审查和重新存储,而且能够加强分析数据的使用,避免因为缺乏对以前工作的认识或可见性而重复工作(Mnova Database功能)。
在实际应用中,公司又有了新的需求,Mnova能否做到仪器采集完数据就保存到数据库里,后续进行批量数据检索,检索完成能够得到一个详细的报告?
Mnova Gears
为了满足以上需求,Mestrelab研发团队推出了新功能——Mnova Gears(Mgears),这一功能的实现可以将实验员从繁杂重复的数据处理、分析中解放出来,极大的提高工作效率。
Mgears插件中的产品包括Mnova Gears(多样本分析的自动化,通过批处理或实时模式对数据进行分析)、Mnova MyGears(单样本分析的自动化,在打开的Mnova文档中进行自动化操作)、Mnova Gears Bricks(选择需要实现的自动化功能)。
产品特征:
1. 灵活的数据输入方式。
可以选择磁盘、数据库或实时采集的方式输入数据,支持多种格式的数据(比如来自不同仪器的NMR、MS、IR和UV光谱等)。
2. 规范的数据处理过程,节约时间。
用户可以选择“Advised processing”(插件内置的处理方式)、创建处理模板或自定义的方式来简化数据处理过程(如基线校正、充零、相位校正、定标等)。通过让Mnova在后台运行,可以节约时间。
3. 自定义工作流程并实现自动化。
根据需要选择单个或多个功能插件,可以实现多种功能的自动化(比如多重峰分析报告、批量数据检索、结构验证等)。
4. 自定义报告格式,结果文件多样。
可以通过模板或脚本对报告进行个性化设置,导出的结果包括.mnova、pdf、html、log等格式的文件。
5. 通过Mgears Viewer可以对结果进行回顾和纠正。