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CUT&Tag技术
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参考报价: 面议 型号: CUT&Tag技术
品牌: 康测科技 产地: 武汉
关注度: 19 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
供应商性质生产商产地类别国产
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                       一、产品简介
CUT&Tag是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,与传统的ChIP-Seq研究方法相比,该技术无需交联、超声打断、末端修复和接头连接等操作,因此具有省时高效、所需的样品量少(低于10万个细胞即可),背景信号低、可重复性好和测序数据量少等优点,甚至可用于单细胞水平研究。CUT&Tag对基因调控、表观遗传等领域的研究具有革命性的意义。

二、项目流程

三、CUT&Tag技术应用
1.挖掘蛋白质一DNA相互作用
2.检测基因组上的组蛋白修饰,鉴定超级增强子
3.检测转录因子的结合位点

四、CUT&Tag 与ChIP-seq 性能比较


 

五、部分结果展示


 

六、案例解读

Nature Communication : CUT&Tag高效分析小样本和单细胞的表观基因组学[1]
本研究对比了ChIP-seq、CUT&RUN、CUT&Tag三种方法检测多种组蛋白修饰、RNAPII、 转录因子、染色质开放性的效果。
1.更高的信噪比

上图:三种方法检测H3K27me3修饰, CUT&Tag检测灵敏且信噪比高

Henikoff等人在对组蛋白H3K27me3进行研究时对比使用了ChIP-seq、CUT&RUN、CUT&Tag三种方法。通过相同的数据量(8M Reads)进行比较分析发现,三种方法对应的染色体景观相似,但是ChIP-seq需要更高的测序深度才能达到去背景噪音的效果,而CUT&Tag有较低的背景噪声和较强的信号。

2.更高的重复性


上图:CUT&Tag的重现性和效率
 

使用CUT &Tag、CUT & RUN和ChIP- seq三种实验方法(各两种生物学重复)鉴定染色体H3K4me1组蛋白修饰。实验数据证实CUT&Tag的灵敏度更高,实验可重复性更好。

参考文献:
[1] Kaya-Okur HS, Wu SJ, Codomo CA, et al. CUT&Tag for eficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nature Communication,2019 ,10(1):1930.
 


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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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