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使用DS3000 Compact CE Sequencer 进行细胞鉴定的实例
发布时间：
2022-06-22 14:40
来源：
日立诊断产品（上海）有限公司
| 领域： | 分子生物学,基因/基因组/测序 | ||
| 样品： | 细胞基因组DNA | 项目： | 细胞鉴定 |
| 参考： | Authentication of Human Cell Lines: Standardization of STR Profiling. ANSI/ATCC ASN-0002-2011. ，Capes-Davis, A., et al. Match criteria for human cell line authentication: Where do we draw the line? Int. J. Cancer 132, 2510–2519 (2013) AB | ||
| 方案文件名 | 下载 |
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使用DS3000 Compact CE Sequencer 进行细胞鉴定的实例 |
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细胞株的误识别或污染，将对实验结果有很大的影响。 因此，推荐定期实施细胞株鉴定(Cell Line Authentication: CLA)，并确认无外来细胞的混入或置换。 在CLA中，广泛使用对STR(Short Tandem Repeat)进行分析的方法。 STR是散布在基因组中的以2-7个碱基短串联重复序列。 不同个体间的STR的重复次数（等位基因）各不相同，因此STR是DNA鉴定中很有用的标记。 在CLA中首先用PCR扩增多个STR后，通过毛细管电泳鉴定每个等位基因。 然后，将已鉴定的等位基因与在ATCC(American Type Culture Collection)等生物资源中心注册的各个的等位基因（以下，标记为参考等位基因）相比较而鉴定细胞株（1）。 此时，为了获取高可靠性的结果，仪器需要具有高分析性能。
在此，介绍使用DS3000 Compact CE Sequencer (以下简称DS3000)时的CLA实例。 用GenePrint® 10 System与GenePrint® 24 System (Promega®)验证的结果，以DS3000获取的等位基因与参考等位基因的一致程度为大于等于80%时，将其判断为相同细胞（2）。 由此可知，DS3000具有可进行CLA的分析性能。
