Illumina HiSeq 3000/HiSeq 4000测序系统

应用生产规模级测序的新标准

基于HiSeq 2500系统的成熟性能，并凭借超高通量 HiSeq X 系统的图案化流动槽技术，HiSeq 3000/4000测序系统带来了无可匹敌的测序速度和性能。它们提供了zei高的覆盖度，出色的运行周期，以及处理多个样品的灵活性，为生产规模级基因组学实验室提供了一个完整的方案。
快速、高通量的测序适合多个应用

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统带来了zei高的单日测序通量和每个样品的zei低价格，适用于广泛的应用，也成为开展各种基因组应用的高通量实验室的理想选择。HiSeq 4000系统能够在3天内测序12个基因组、100个转录组，或180个外显子组。这种无可匹敌的能力意味着更多样品以更高的深度同时并行测序，产生更加丰富、更有意义的数据。

灵活的配置
双流动槽的HiSeq 4000系统能够平行处理一个或两个流动槽，带来zei大的数据输出和zei高的单日测序通量，其每次运行能够产生1.5 Tb (terabases)和50亿条序列。HiSeq 3000系统的每个流动槽产量与HiSeq 4000系统相同，但每次只能处理一个流动槽，故每次运行能带来750 Gb和25亿条序列。当通量需求增加时，HiSeq 3000系统也能升级到HiSeq 4000系统。

成熟的Illumina技术
HiSeq 3000/HiSeq 4000系统利用了Illumina所有NGS（新一代测序）系统所使用的可逆终止子边合成边测序(SBS)化学法。SBS提供了卓越的数据质量，是行业中采用zei广泛的测序方法。凭借在HiSeq X Ten系统中首次使用的图案式流动槽创新技术，HiSeq 3000/HiSeq 4000系统带来了非凡的测序通量。

直观的生物信息学
HiSeq 3000/HiSeq 4000系统与云端的BaseSpace基因组学计算环境相整合，后者能提供简单、可扩展的数据分析和存储。BaseSpace环境包括通过苹果商店访问第三方应用程序，用于下游分析。BaseSpace计算特有实时的数据上传、比对和变异检出，运行监控，以及与世界上任何人即时共享数据的选项。

高通量低成本的、大规模级基因组学

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统利用创新的图案化流动槽技术，提供了快速、高效的测序。快速经济地开展大规模级的高通量外显子组或转录组测序项目。

大规模测序的多个应用

HiSeq 3000/HiSeq 4000测序系统基于HiSeq 2500系统的成熟性能，利用超高通量HiSeq X系统的图案化流动槽技术，提供出色的测序速度和性能。HiSeq 3000/HiSeq 4000提供了高覆盖度、快速周转和处理各种样本类型的灵活性，为大规模的基因组实验室提供了多个应用的解决方案。

快速、高通量的测序适合多个应用

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统以低成本带来了高通量，适合各种基因组应用。在不到3.5天的时间内，HiSeq 4000系统zei多可以对12个基因组、100个转录组或96个外显子组进行测序。这种高性能意味着更多样本可在更高深度下同时测序，产生丰富而有意义的数据。

灵活的配置

双流动槽的HiSeq 4000系统可平行处理一个或两个流动槽，每次运行能够产生1.5 Tb和50亿条read，实现很高的产出和单日测序通量。HiSeq 3000系统中每个流动槽的产出与HiSeq 4000系统相同，但每次只能处理一个流动槽，故每次运行能提供750 Gb和25亿条序列。当通量需求增加时，HiSeq 3000系统也能升级到HiSeq 4000系统。

直观的生物信息学

Illumina提供广泛的HiSeq 3000/HiSeq 4000软件方案，帮助您从生物学样本中获得有意义的结果。BaseSpace Sequence Hub为Illumina测序数据的分析和存储提供了一个整合的方案。通过全基因组测序、外显子组/富集和RNA-Seq的应用程序，BaseSpace Sequence Hub可简化NGS数据分析，同时为数据存储、共享和转移提供了一种有效的手段。

简介

在过去十年间，Illumina边合成边测序(SBS)技术已经彻底变革了新一代测序(NGS)的发展，HiSeq系列测序系统也成为高通量、生产级测序实验室的首选平台。基于成熟的HiSeq2500系统，凭借zei初为HiSeqX™Ten系统而开发的有序流动槽技术，HiSeq3000/HiSeq4000系统带来了无可匹敌的速度和性能。

要点

•      大幅提升数据通量

•      采用创新的有序流动槽技术zei大限度提高效率•

•      卓越的数据质量

•      采用成熟的、行业领先的Illumina边合成边测序技术•

•      无以伦比的测序能力

•      3.5天内可完成12个基因组、100个转录组或180个外显子组测序

更高通量，更快获取结果

为超高通量而设计，HiSeq3000/HiSeq4000系统的每个流动槽在3.5天内可产生>750Gb的数据。双流动槽的HiSeq4000系统（图1）具有zei高的单日测序通量和每个样品的zei低价格，适合zei广泛的应用。HiSeq4000系统每天可产生>400Gb测序数据，每次运行通量高达1.5Tb。

这种更强的测序能力意味着可以以更高的测序深度完成更多样品的检测，同时，以更短时间获取更加丰富、更有意义的数据。大型研究项目能够更快完成，且手工操作时间更短，成本更低。HiSeq3000系统的每个流动槽产量与HiSeq4000系统相同，但每次只能处理一个流动槽，故每天能产生>200Gb数据，单次运行通量为750Gb。

创新的有序流动槽

利用在HiSeqXTen系统上首次引入的有序流动槽新技术，HiSeq3000/HiSeq4000系统带来了出色的测序通量。有序的流动槽上的固定位置包含了数十亿个纳米孔（图2）。

这种有序的结构使得簇间隔均匀和大小均一，便于准确分辨以极高密度成簇的流动槽。zl的成簇方法，排斥扩增技术，确保单个孔中只有单个DNA模板结合并形成簇，带来高的孔占有率和zei大的数据产量。利用这一技术，HiSeq3000/HiSeq4000系统的每个流动槽在3.5天内可完成多达6个基因组、50个全转录组样品或90个外显子组测序。

成熟的技术，卓越的数据质量

为了获取高的数据质量，HiSeq3000/HiSeq4000系统利用了Illumina所有测序系统所使用的成熟逆终止子法，在单个碱基掺入DNA模板链时对其进行检测。在每个测序循环过程中，所有4种可逆终止子结合的dNTP都存在，与其他技术相比zei大限度降低了掺入偏好性，并大大降低了原始错误率。1,2zei终实现了高度准确的逐个碱基测序，几乎避免了序列背景特异性错误，即使是高度重复的区域和均聚物区域。HiSeq3000/HiSeq4000系统可产生与HiSeq2500系统相当的高质量数据，且总的产量大大提升，运行时间明显缩短。Illumina测序带来了行业中zei准确的基因组、外显子组和转录组测序，zei高通量量的无错误序列，以及zei高比例的高质量数据（高于Q30)。

灵活的配置

zei新的HiSeq测序系统有单流动槽或双流动槽仪器可供选择，以满足各种通量需求（表1）。HiSeq4000系统能够同时处理1或2个流动槽，在zei短的时间内带来了zei大的产量和zei高的通量。HiSeq3000系统每个流动槽的产量与HiSeq4000系统相同，但每次只能处理1个流动槽。即使是1个流动槽，HiSeq3000系统每天仍能产生>200Gb测序数据。为了满足挑战性测序通量需求，HiSeq3000系统能够快速轻松地现场升级到双流动槽的HiSeq4000系统。升级后的HiSeq3000系统带来了与工业级HiSeq4000系统相同的性能、通量以及每个样品的价格。

完整的测序方案

Illumina提供覆盖整个测序流程的完整产品线，从文库制备到数据分析（图3）。

TruSeqDNA和RNALibraryPrepKits支持HiSeq3000/HiSeq4000系统上的全基因组测序、外显子组测序和RNA-Seq。HiSeq3000/4000ReagentKits为簇生成和测序提供了即用型的试剂，能缩短手工操作时间，并减少潜在的操作失误。目前提供三种不同的用于HiSeq3000/HiSeq4000系统的SBS测序试剂。SBS测序试剂提供50个循环、150个循环和300个循环的规格。多个试剂盒规格实现了2x150bp的读长，并支持双索引流程。HiSeq系统能够与云端的BaseSpace®计算环境整合，后者能提供简单、可扩展的数据分析和存储。BaseSpace环境包括通过苹果商店访问第三方应用程序，用于下游分析。目前可用的应用程序包括适用于WGS和外显子组富集的BWA和Isaac™，以及适用于RNA-Seq的Express和Tophat/Cuf‑inks。BaseSpace云计算环境特有实时的数据上传、比对和变异检出，运行监控，以及与世界上任何人即时共享数据的选项。

直观的系统控制软件

HiSeq3000/HiSeq4000系统提供了易于使用、触摸屏操作的仪器控制软件。通过优化的逐步指导，控制软件能指导用户完成测序流程中的每一步，包括实验设置，以及试剂和流动槽的上样。此软件还能实时产生数据质量统计，

结语

HiSeq3000/HiSeq4000系统融合了行业领先的SBS技术和创新的有序流动槽技术，带来了zei高的单日通量，zei快的运行时间和每个样品zei低的成本，适合更广泛的应用。有了HiSeq3000/HiSeq4000系统，每个实验室都能接触到zei新的测序技术，并增强他们的基因组学实力。