主要技术指标:
全新的Chromium™系统可以解决二代测序基因组组装 contig 过短、组装较碎,组装序列大片段连接错误、染色体挂载率较低等难题。 常规数据量即可轻松实现重复序列定位、复杂染色体结构变异检测。 比三代测序更便宜、更准确。 分辨率更高,该平台的分区由原来的10万个增加到100万个,条形码的数目由75万增加到400万,因而,每一个分区中的DNA分子数由50个变为5个,极大的提升了组装质量,这些改进将帮助测序更接近单分子水平;GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,产生长片段信息
参考招标参数:
招 标 编 号:TC18034GG/03
招标项目名称:中国医学科学院基础医学研究所2018 实验室设备采购项目—— 全流程病理制片系统等设备
品目八:液滴文库构建系统
1.仪器主要用途:
应用微流体芯片将细胞悬液样品在油包水体系中快速进行分区,而后添加序列标签,对样品中的数千个单细胞进行建库,建好的文库可上机进行测序,最终进行解码分析,解读细胞群体的动态基因表达谱
2.仪器工作条件:
2.1 电源要求:100-240V,50-60Hz
2.2 洁净度:2 级(仅适用于室内使用)
2.3 使用温度要求:18-28 摄氏度
2.4 湿度:最大 85%(无冷凝)
2.5 海拔高度:0-2000 米
3.处理样本类型:一种微流体芯片兼容不同大小及不同类型的真核细胞(贴壁细胞、悬浮细胞、组织、血液等)
4.简单的实验操作流程:仪器每次运行时间为 7 分钟,实现快速裂解细胞对基因表达影响最小,精确地获得转录组数据
*5.样本处理通量:仪器可同时运行 1-8 个通道,每次运行最多可产生 48,000个单细胞的转录本
6.分区与标签数:每次运行产生>8 万个纳升级分区,含有 75 万个独特的序列标签(每个标签由 14 个碱基构成)
*7.细胞捕获效率:在群体中捕获大于 50%的细胞,每 1000 个细胞中含有双细胞的比例低于 0.9%
*8.文库测序仪兼容性:系统提供 Illumina 兼容测序文库,建库样本满足illumina 测序仪要求
9.应用类型:可提供 3’基因表达谱文库,5’基因表达谱文库,T 细胞受体和 B细胞受体 VDJ 区域全长测序文库
10.分析软件及功能:提供操作简便、单机版一站式分析及可视化软件,以高通量数字化形式深度解析细胞群体中所包含每个细胞的表达基因及其丰度
11.软件运行服务器最低配置要求:16 核 Intel 或 AMD 处理器,128 GB 内存,1TB 存储空间,64 位操作系统
*12.配套质检用核酸定量仪一台及细胞计数仪一台
*13. 仪器质保期:自安装调试完成后至少 5 年;
维护响应时间:接到报修通知后 2小时内响应,24小时到达现场并修复。
免费提供中文、英文操作手册(如为进口设备)、维护手册各 1 套。
应进行免费技术培训,每年 2 次。培训内容包括:设备的基本操作、日常维护等。
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