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Ion PGM 个人化操作基因组测序仪 (PGM)

tel: 400-6699-117 9566

赛默飞基因/DNA测序仪, 新一代测序,简捷、扩展和快速、无需光......

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Ion PGM™ 系统的性能规格
  Ion 314™ 芯片v2Ion 316™ 芯片v2Ion 318™ 芯片v2
产量200个碱基30-50 Mb300-600 Mb600 Mb – 1 Gb
 400个碱基60-100 Mb600 Mb – 1 Gb1.2-2 Gb
读取 40-55万个200-300万个400-550万个
运行时间200个碱基2.3小时3.0小时4.4小时
 400个碱基3.7小时4.9小时7.3小时
研究领域 癌症研究干细胞研究宏基因组学
  遗传病研究农业法医学
  微生物学表观基因组学古老DNA基因组学
关键应用 定向DNA测序de novo微生物测序ChIP测序
  拷贝数分析细菌分型甲基化分析
  定向RNA测序病毒分型SNP验证
  小RNA测序宏基因组学测序法基因分型
目标选择方案 Ion AmpliSeq™技术Ion TargetSeq™ 技术 
文库方案 Ion AmpliSeq™ Library KitIon Total RNA-Seq Kit v2384个条形码,Torrent Suite™
  Ion Xpress™ Plus FragmentIon Library Equalizer™ Kit软件所支持
  Library Kit  
数据分析方案 Torrent Suite™软件处理信号,检出碱基,比对序列,并开展基本变异检出,作为Ion PGM™测序仪的初步分析软件。
   
  定向DNA测序、定向RNA测序、微生物de novo测序、微生物分型及其他应用的优化数据分析流程已开发,利用第三方软件方案和免费下载的插件。
   
  Ion Reporter™软件开展可控的变异分析、注释和报告,而应用特异的流程支持单个、家系以及配对的肿瘤正常分析。
  Ion Reporter™ Oncomine®流程再加上Ion AmpliSeq™ DNA panel,让癌症研究人员能够解决区分癌症司机突变和乘客突变的关键挑战。
   

 

Ion PGM™ 测序仪的规格
工作环境温度:68–77°F (20–25°C)间隙: 
(仅限室内使用)湿度:40-60% 非冷凝后面12 in (30.5 cm)
 海拔:<6500 ft (2,000 m)左侧4 in (10 cm)
  右侧4 in (10 cm)
  从工作台前缘到测序仪面板4 in (10 cm)
  工作台前方通道36 in (90 cm),方便操作员操作
  从工作台前缘到锥形管8 in (20.3 cm)
气体供应连接:0.25一键连接配件压力:35-45 psi成分:氩气(4.5级,纯度为99.995%或以上)
其他连接以太网:1 GigEUSB:2个USB 2.0 
电源电压:100V (min) - 240 V (max)频率:50/60 Hz 
 电流:9A (max)功率:200-300 W 
尺寸宽度:24 in/61 cm深度:20 in/51 cm高度:21 in/53 cm
重量运输箱:85 lb/39 kg独立:65 lb/30 kg 

 

PGM™ Torrent服务器的规格
产品配置单个独立的塔式计算机设备,包含在Ion PGM™ 系统内。
 包括Torrent Suite™ 软件及所有必要的软件组件,带来信号处理、碱基检出、读取比对和变异检出。
处理器两个6核2.66 GHz CPU
内存48 GB RAM
GPU处理器1x NVIDIA® Tesla® GPUs
存储(约)16 TB
操作系统Ubuntu® 10.04
尺寸宽度:8.5 in/21.6 cm深度:22.3 in/56.6 cm高度:22.3 in/56.6 cm
重量100 lb/45 kg
电源电压:100V (min) - 240 V (max)频率:50/60 Hz 
 电流:6.7A (max)功率:1,100 W 
数据格式行业标准的FASTQ、SFF、BAM和VCF格式输出

 
工作流程:




Ion PGM  Sequencer Specifications   Ion PGM  测序仪技术参数

Chip 芯片Expected Sequencing Run Time
期待的测序时间
                 Expected Output*
期待的通量
                 Expected Reads
期待的测读量
                                 200-base reads                400-base reads                200-base reads                400-base reads                 
Ion 314&trade; Chip v2                2.3 hr                3.7 hr                30-50 Mb                60-100 Mb                400-550 thousand
Ion 316&trade; Chip v2                3.0 hr                4.9 hr                300-600 Mb                600 Mb-1 Gb                2-3 million
Ion 318&trade; Chip v2                4.4 hr                7.3 hr                600 Mb-1 Gb                1.2-2 Gb                4-5.5 million

    *Expected output with >99% aligned/measured accuracy.  Output is dependent on read length and application.  

                Specifications for the Ion PGM&trade; Sequencer
                Working environment [for indoor use only] 工作环境(室内)                Temperature: 68–77°F (20–25°C)
Humidity: 40–60% non-condensing
Altitude:<6,500 ft (2,000 m)
Clearances: 
12 in (30.5 cm) in rear
4 in (10 cm) on left side
4 in (10 cm) on right side
4 in (10 cm) from front edge of bench to sequencer bezel
8 in (20 cm) from front edge of bench to the conical tubes
36 in (90 cm) aisle in front of bench for operator access
                Gas supply 供气                Connection: 0.25 in push-to-connect fitting
Pressure: 35–45 psi
Composition: Nitrogen (grade 4.5, 99.995% or better)
                Other connections 其它连接                Ethernet: 1GigE
USB: 2x USB 2.0
                Power 供电                Voltage: 100 V (min) to 240 V (max)
Current: 9 A (max)
Frequency: 50/60 Hz
Power draw: 200-300 W
                Dimensions 尺寸                Width: 24 in (61 cm)
Depth: 20 in (51 cm)
Height: 21 in (53 cm)
                Weight 重量                Crated for shipment: 85 lb (39 kg)
Free-standing: 65 lb (30 kg)
                Additional Equipment 附加设备                PGM&trade; Torrent Server 
Ion Chef&trade; System
Ion OneTouch&trade; System

     




厂家资料

地址:上海市虹桥路1号港汇中心1座17楼

电话:400-6699-117 转 9566

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