快速的基因组规模台式测序
Ion Proton™系统是一个台式测序系统,它能够在几小时内在Ion PI™ 芯片上实现外显子组和转录组测序。
随着Ion PII™ 芯片*的发布,Ion Proton™ 系统将带来人类规模的基因组测序-一天之内从DNA到变异。
Ion Proton™ 测序仪的规格
工作环境(仅限室内使用)
温度:20–25°C
湿度:40-60% 非冷凝
海拔:<6500 ft (2,000 m)
间隙:
后面 30.5 cm
左侧 10 cm
右侧 10 cm
从工作台前缘到测序仪面板 10 cm
工作台前方通道 90 cm,方便操作员操作
可选的机架安装,每个架子上放两台Ion Proton™ 测序仪†
气体供应
连接:0.25 in一键连接配件
压力:30 psi
成分:氮气 (4.8级,纯度为99.998%或以上)
其他连接
以太网:1 GigE
USB:2x USB 2.0
电源
电压:100 V (min) 至240 V (max)
电流:14 A (max)
频率:50/60 Hz
耗电量:1,350 W
大小
宽度:54.2 cm
深度:77.5 cm
高度:47.4 cm
重量
运输箱:90.7 kg
净重:59 kg
仪器的计算机硬件
处理器:两个8核Intel
® Xeon® Sandy Bridge
内存:128 GB RAM
FPGA:两个Altera® Stratix® V
GPU处理器:1 x NVIDIA® Tesla® C2075
硬盘:11 TB (SSD和HDD)
操作系统:Ubuntu ®11.10
Proton™ Torrent服务器的规格*
产品配置
一台独立的塔式计算机设备,包含在Ion Proton™ 系统内。
包括Torrent Suite软件以及提供信号处理、碱基检出、读取比对和变异检出所必需的所有软件组件。
处理器 :两个8核2.9 GHz CPU
内存 128 GB RAM
GPU处理器 2x NVIDIA® Tesla® GPUs
硬盘 (大约) 27 TB (足够存储>50块Ion PI ™ 芯片的运行)
操作系统 Ubuntu® 10.04
大小 (大约) 宽度:21.8 cm 深度:71.4 cm 高度:43 cm
重量 (大约) 55 kg
电源
电压:100 V (min)至240 (max)
电流:12 A (max)
频率: 50/60 Hz
耗电量:1,100 W
Ion Proton™ 系统的性能参数*,带Ion PI™ 芯片
通量
高达10 Gb
(注意:Ion PII™ 芯片将在IonPI™ 芯片发布后6 个月上市。Ion PII™芯片*将在一天之内实现人类基因组的从样品到变异分析,覆盖度高达20 倍。)
读长:高达200个碱基的片段读取
通过过滤的读取数量:6000-8000万个通过过滤的读取
测序运行时间:2–4 小时
核心应用
人类规模的基因组测序
外显子组测序
小型基因组测序
基因测序
ChIP测序
甲基化分析
De novo测序
全转录组
测序法基因表达分析
小RNA测序
现有的文库方案:
Ion AmpliSeq™ Library Kit
Ion TargetSeq™ Exome Kit
Ion Xpress™ Plus Fragment Library Kit
Ion Total RNA-Seq Kit
感兴趣的领域:
农业研究
癌症研究
法医学
干细胞研究
表观基因组学
宏基因组学
古老DNA基因组学
条形码方案:Torrent Suite软件支持的384个条形码 96个DNA现货条形码 16个RNA现货条形码
软件方案:
Torrent Suite软件利用Torrent Browser (包括TMAP比对)和Torrent Variant Caller来进行生殖细胞和体细胞突变检测
Torrent Browser (已含)让用户可远程联网访问仪器状态监控、运行质量报告、单个数据文件以及应用特异分析可扩展插件
插件可从Torrent Browser Plugin Store中下载,用于基因组测序、定向测序、变异分析和注释、微生物测序的分析,转移至第三方的生物信息学软件包,以及更多数据可选择导入Ion Reporter™软件,用于可控的变异分析、注释和报告。Ion Reporter™软件为支持单个、三个或配对的肿瘤正常分析提供了应用特异的流程。
数据形式 :行业标准的FASTQ、SFF、BAM和VCF形式输出
订购信息:
Ion Proton™ System (includes Ion Proton™ Sequencer and Proton™ Torrent Server) 货号:4476610
Ion OneTouch™ 2 System 货号:4474779
* 此处提供的内容可能涉及未正式发布的产品,随时可能更改,恕不另行通知。
为节省空间,可购买适用于Ion Proton™ 系统的机架。详询您的销售代表。
快速的基因组规模台式测序
Ion Proton 系统是一个台式测序系统,它能够在几小时内在Ion PI™ 芯片上实现外显子组和转录组测序。
随着Ion PII 芯片*的发布,Ion Proton 系统将带来人类规模的基因组测序-一天之内从DNA到变异。
* 此处提供的内容可能涉及未正式发布的产品,随时可能更改,恕不另行通知。
为节省空间,可购买适用于Ion Proton系统的机架。详询您的销售代表。
Ion Proton™系统规格
Specifications for the Ion Proton™ Sequencer | |
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工作环境 (仅供室内使用) | Temperature: 68-77° F (20-25° C) Humidity: 40-60%, noncondensing Altitude:<6,500 ft (2,000 m) Clearances: 12 in (30.5 cm) in rear |
Gas Supply | Connection: 0.25 in push-to-connect fitting Pressure: 30 psi Composition: nitrogen (grade 4.8, 99.998% or better) |
其它连接 | 以太网: 1 GigE USB: 2x USB 2.0 |
电源 | 电压: 100 V (min) to 240 V (max) Current: 14 A (max) Frequencing: 50/60 Hz Power Draw: 1,350 W |
尺寸 | 宽度: 21.3 in/54.2 cm 深度: 30.5 in/77.5 cm 高度: 18.7英寸/47.4 cm |
重量 | 运输装箱: 200 lb/90.7 kg Free-standing: 130磅/59 kg |
仪器计算硬件 | 处理器: Dual 8-core Intel® Xeon® Sandy Bridge Memory: 128 GB RAM FPGA: Dual Altera® Stratix® v. GPU processor: 1 x NVIDIA® Tesla® C2075 Storage: 11 TB (SSD and HDD) Operating system: Ubuntu® 11:10 |
Proton™ Torrent服务器规格* | |
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产品配置 | A single free standing tower computer appliance, included with the purchase of the Ion Proton™ System. 包括Torrent Suite软件及提供信号处理、碱基检测、读数校准和变异体检测需要的所有软件组件。 |
处理器 | 双8核 2.9 GHz CPU |
存储器 | 128 GB RAM |
GPU处理器 | 2x NVIDIA® Tesla® GPUs |
存储 (约) | 27 TB (sufficient for storage of >50 Ion PI™ Chip runs) |
操作系统 | Ubuntu 10.04 |
尺寸 (约) | 宽度: 8.5 in/21.8 cm 深度: 28 in/71.4 cm 高度: 17英寸/43 cm |
重量 (约) | 120磅/55 kg |
电源 | 电压: 100 V (min) to 240 V (max) Frequency: 50/60 Hz Current: 12 A (max) Power Draw: 1,100 W |
Ion Proton™ System performance specifications with Ion PI™ Chip | |
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通量 | 高达10 Gb (注: The Ion PII™ Chip* will be available about six months after the Ion PI™ Chip. Ion PII™ Chip* will enable sample-to-variant analysis of a human genome in a single day, at up to 20x coverage.) |
读取长度 | 高达200碱基片段读数 |
Number of reads passing filter | 60-80 million reads passing filter |
测序运行时间 | 2-4 小时 |
主要应用 | 人类基因组规模测序 ChIP sequencing Whole transcriptome sequencing外显子组测序 甲基化分析Gene expression by sequencing Small genome sequencingDe novo 测序: Small RNA sequencingGene sequencing |
Areas of interest | Agricultural research 干细胞研究 癌症研究 Epigenomics Ancient DNA genomics Forensic scienceMetagenomics |
Barcoding solutions | 384 barcodes supported by Torrent Suite Software 96 off-the-shelf barcodes for DNA 16 off-the-shelf barcodes for RNA |
软件解决方案 | Torrent Suite 软件采用了Torrent浏览器,包括TMAP校准和Torrent变异体检测程序,用于生殖细胞系或体细胞突变检测。 Torrent浏览器 (仪器中已包括) 允许用户通过远程网络访问仪器状态监控、运行质量报告、单个数据文件以及用于应用特异性分析的可扩展插件。 Plugins available for download from the Torrent Browser Plugin Store for analysis of genome sequencing, targeted sequencing, variant analysis and annotation, microbial sequencing, transfer to 3rd party bioinformatics packages, and more. Data can optionally flow into Ion Reporter™ Software for controlled analysis, annotation, and reporting of variants. Ion Reporter™ Software provides application specific workflows to support single, trio and paired tumor normal analysis |
数据格式 | Industry standard FASTQ, SFF, BAM and VCF format outputs |
*此处所述内容可能涉及一些未正式发布的产品,且均有可能更改,恕不另行通知。
†Space-saving rack can be purchased for the Ion Proton™ System. Contact your sales representative for details.
此处提及的商标均为Life Technologies公司和/或其附属机构或各自所有者的资产。 Intel和Xeon是Intel公司的注册商标。 NVIDIA和Tesla是NVIDIA公司的注册商标。 Altera和Stratix是Altera公司的注册商标。 Ubuntu is a registered trademark of Canonical Ltd.
除厂家/中国总经销商外,我们找不到 Ion Proton 新一代测序仪 的一般经销商信息,有可能该产品在中国没有其它经销商。
如果您是,请告诉我们,我们的邮件地址是:sales@antpedia.net 请说明: 1.产品名称 2.公司介绍 3.联系方式 |
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