MiSeq系统的专注功能
实现重点的应用,如靶向重测序、元基因组、小型基因组测序、靶向基因表达分析等。MiSeq的试剂可带来2500万条测序read和2 x 300 bp的读长,实现高达15 Gb的产出。
zei短的时间内获得答案,智能化的工作流程,广泛的测序应用范围
Illumina公司推出的MiSeq是目前唯一一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪,每次运行能产生超过1 Gb的数据,且占地面积仅为2平方英尺。MiSeq有着革命性的流程和无可比拟的准确性,这让它成为快速且经济高效的遗传分析的理想平台,适合广泛的应用。同时根据Illumina的zei新消息,今年9月份左右,MiSeq系统的测序通量将会升级至7G左右。升级将通过两个方面完成,一个是cluster密度的增大,升级后cluster密度将会增加至12-15million,而pair-end读取的reads数目将会增加至24-30million;另一方面是通过测序读长而提升通量,届时测序读长会达到2*250bp,同时测序速度也会有所提升。目前,Broad研究院已经利用现有试剂实现了单端测序300bp读长,Illumina目前内部测序更是完成了2*400bp的pair-end测序。而这些,都是保证在高质量数据结果的前提下完成的。
工作流程
4大特性
1、zei短的实验周期:从样品制备开始只需要8小时即可得到超过100M的高质量测序结果。
2、zei便捷的样品制备流程:只需50ngDNA模板,2小时的自动化操作就可以完成全部样品制备工作。
3、zei精确的测序原理:MiSeq继续GA和HiSeq平台的边合成边测序的化学原理,数千篇高质量的国际期刊文章是对Illumina NGS平台测序结果可信度zei有力的证明。
4、zei完整的整合功能:MiSeq可以独立完成簇生成,双向测序及数据分析工作,让经费和实验室空间不再成为NGS研究的障碍。
应用范围
1、转录组测序
派森诺MiSeq测序平台是基因组已测序物种的转录组分析zei佳平台。公司技术团队目前已完成了包括斑马鱼在内的多种植物、动物的转录组测序及分析。
2、宏基因组16S rDNA单V区测序
对16s rDNA的单V区(V3\V4)进行高通量测序,鉴定细菌群和古生菌群。派森诺的技术团队使用Illumina MiSeq测序16S rDNA V4区并结合Roche 454 FLX+测序16S rDNA V1~V3区成功的对鸡的肠道环境细菌进行了鉴定。
3、Small RNA测序
1*35bp的读长完美地配合了小RNA的测序长度,速度快,灵敏度高。派森诺的技术团队目前已完成了鹅的小RNA测序和多种中草药的小RNA测序。
4、重测序:
包括全基因组重测序、简化基因组测序、外显子测序。
Illumina MiSeq非常适用于对微生物基因组的重测序,每次运行即可完成一个微生物基因组测序。2011年12月27日,派森诺的技术团队利用MiSeq一次运行同时完成了乳酸菌
(Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8)的重测序,基因组覆盖深度为分别为404倍和213倍,比对至参考序列,基因组覆盖率为100%,同时检测到了多种结构变异,包括插入、缺失和SNP位点,并且检测到了全部质粒。
法规声明 | 仅供研究使用。不得用于诊断。 | 用于 体外 诊断。联系我们了解区域可用性。 | 仅供研究、法医和亲子鉴定使用。 |
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主要应用 |
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IVD检测菜单 | 不可用 |
| 不可用 |
Universal Kit | 不可用 | Universal Kit V1.0(获得FDA批准的文库制备和测序试剂盒,用于进行LDT) | 不可用 |
Forensic Genomics Kit | 不可用 | 不可用 | ForenSeq DNA Signature Prep Kit |
研究应用 | 用于多种应用的台式测序仪 | 与MiSeq相同(使用研究模式运行时) | 与MiSeq相同(使用研究模式运行时) |
系统软件 | 完全集成的生态系统,包括机载数据分析。IVD应用不可用。 | 完全集成的生态系统,包括机载数据分析。软件分为IVD专用和研究专用两种。 | ForenSeq Universal Analysis Software |
Illumina Miseq是2011年2月推出的新一代小型化(bench-top)测序仪,这款仪器使用了Illumina TruSeq可逆中止碱基边合成边测序的化学方法,与HiSeq 2000相比,虽然每个Run的测序通量很低,但是久经考验的新一代测序试剂带来无可比拟的准确性,结合上全新的流体系统,使得一个测序循环时间缩短了8倍以上。
技术特点
1、测序周期短:Miseq V2 150PE运行时间短至24小时,可用于快速高效的扩增子测序或小基因组测序,以极少的时间完成数据量需求较少的项目。
2、Pair-end 读长达250bp:Miseq测序读长已经达到2×250bp,可有效地跨越复杂基因组的高度重复区域,从而提高拼装的效果,更有利于进行基因注释和基因功能的深入挖掘。
3、测序流程便捷:小巧、一体化的MiSeq平台整合了cluster生成,Pair-end测序和完整的数据分析,节省了实验室空间。通过直观的触摸屏界面开展简单的仪器操作,即插即用的试剂带有RFID追踪,具有自动化的便利。
测序流程
应用范围
1、扩增子测序
长的末端配对读取能力、速度与高数据质量,使得扩增子测序的项目可在几天内完成。
2、转录组测序
与454测序仪相比,长度类似,价格便宜,便于实现De novo组装,更全面的基因注释。
3、小基因组De novo组装
2×250bp读长与高达7G的测序通量,适合如微生物这类小基因组的项目,拼接效果好。
4、微生物多样性分析
2×250bp读长,已经可以测通一些可变区域,更有利于提高分析结果的准确性。
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