农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
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南京农业大学微生物学科由我国著名的微生物学家樊庆笙先生于1952年创建。 学科建立之初即为微生物学硕士研究生招收单位， 1984年被国务院批准为全国首批微生物学 博士点。 南京农业大学微生物学科对我国微生物学的发展做出了巨大的贡献，于20世纪80年代初各学科“百废待兴”之时举 办了“全国高等农业院校微生物学讲师以上师资讲习班”，“全国厌氧微生物讲习班”，“全国微生物生理生化讲习班”和 “全国重点农业院校生物技术研究生班”，推动了我国微生物学科的发展，并为我国农业领域微生物分子生物学研究的开展奠定了基础。 在学科建设方面，1994年微生物学科被评为江苏省重点学科，并于1999年被评为农业部重点学科。多年来通过世行贷款、科研项目投入和校学科建设贷款，建立了完善的实验设备条件，可以满足从群体、细胞和分子水平进行微生物学研究的需要。本实验室于2001年被列为南京农业大学校级重点建设实验室。
经过多年的积累与发展， 在微生物学科1990年代来取得了良好的发展势头，在农业环境的微生物 保护与治理领域取得了重大的发展。 微生物学科的发展与我国改革开放后经济发展状况密切联系生物固氮、生物钾肥、 农药残留微生物降解、有毒难降解工业废水微生物处理工程与农业废弃物资源化的理论研究和成果转化方面取得了重大的成绩， 为国民经济的建设作出了巨大的贡献。随着社会经济的发展，农业生态环境问题日趋严重， 成为关乎我国农业可持续发展的生死攸关的问题。针对农业生产中农业化学品(氮、磷和农药) 大量使用导致的环境污染及农产品加工产生的废弃物，本学科开展了生物固氮、解磷及农药残留的微生物控制、 治理与农业废弃物资源化的理论和技术研究，在环境微生物工程和环境生物技术的研究方面走在了全国的前列。
