生命科学的数据可视化与科研作图——实用工具与技巧
培训目标
从生物医学科研论文配图的图像处理技术和模式图绘制技术入手,旨在提高科研工作者的绘图技能,提升科研成果的信息展示度。使用国际最流行的数据可视化制作软件(Photoshop、Illustrator、Cytoscape)及生物医学领域专业作图工具(R、IGV、WEGO、iTOL、Pymol、Bioedit),配合制作出符合国际规范的、可投稿至世界任何国际期刊的高质量论文配图。让您轻松应对毕业答辩、成果汇报、项目申请书撰写、著作编纂等工作。
主办单位:北京市计算中心
协办单位:
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
工信部和信息化人才培养工程培训基地
中国生物工程杂志
举办地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
开班时间:2020.4.8-10(报名中)上午9:30-12:00,下午13:30-17:00
内容安排:每天3个主题
1.生命科学可视化与各类图示例 2.SCI论文发表图表的基本要求 3.高清位图(tif等):分辨率PPI/DPI 4.矢量图(SVG等):放大不失真 5.抠图、组图 6.图像色彩转化 7.数据清洗与预处理 8.数据缺失与填补 9.数据格式转化 | |
主题2:通用作图技术与工具 | 10.基础技术:Excel+PPT 11.进阶技术1:PhotoShop(PS) 12.进阶技术2:AdobeIllustrator 13.进阶技术3:AcrobatProfessional(PDF) 14.进阶技术4:科研示意图 |
主题3:常见SCI数据图 | 15.散点图与曲线(Plot):趋势与回归 16.条形图(Bar):比较与差异) 17.直方图(Hist):频率与分布 18.饼图(Pie):百分比 19.箱线图(Box-plot):统计描述 20.韦恩图(Venndiagram):并集与交集 |
主题4:DNA-基因组遗传与变异 | 21.BioEdit:DNA测序峰图 22.GSDS:基因结构图 23.UCSC:基因组图谱 24.Blast:序列比对图 25.IGV:二代测序SNP 26.Weblogo:序列保守 27.Circos:基因组比较-圈图 |
主题5:RNA-基因表达 | 28.MAplot:差异表达 29.火山图: 30.聚类图: 31.热图(Heatmap): 32.WEGO:基因本体 33.PCA图:主成分分析 34.富集分析 |
主题6:蛋白-结构与功能 | 35.蛋白质保守序列 36.蛋白质二级结构 37.蛋白质3D结构展示 38.蛋白质复合体 |
主题7:分子互作-通路与网络 | 39.KEGG:代谢通路图 40.String:分子互作 41.Cytoscape:网络图 42.IPA:高级通路分析 |
主题8:进化树-系统发育与物种分类 | 43.Mega:系统发育树 44.iTOL:进化树美化 45.Evolview:进化树的美化与注释 |
主题9:人体与疾病:全基因组关联分析 | 46.曼哈顿图 47.qqplot 48.HaploView:单倍型图谱 |