Cell Stem Cell八大热点文章（11月）
《Cell Stem Cell》杂志是2007年Cell出版社新增两名新成员之一（另外一个杂志是Cell Host & Microbe），这一杂志内容涵盖了从最基本的细胞和发育机制到医疗软件临床应用等整个干细胞生物学研究内容。这一杂志特别关注胚胎干细胞、组织特异性和癌症干细胞的最新成果。《Cell Stem Cell》自创刊以来就倍受关注，影响因子迅速提升，从0一冲至16.826，又达到了25.315。其中最受关注的文章包括：
Directly Reprogrammed Human Neurons Retain Aging-Associated Transcriptomic Signatures and Reveal Age-Related Nucleocytoplasmic Defects
伴随着年龄增长，我们的大脑细胞会出现逐级改变直至衰老，包括基因表达出现差异，细胞膜开始退化，年轻细胞内的分子开始分化、散乱。这些成熟、衰老的过程有哪些机制呢？脑细胞的衰老与衰退型神经疾病有哪些关联呢？生物医学家们一直在致力于解开谜题。
近期，美国萨克生物研究所的研究团队研发出一种将普通皮肤细胞培育成人老化神经元细胞的新方法，为研究逆转时间对细胞、疾病的影响提供最理想材料。
过去，科学家们已经能够借助干细胞技术培育出神经元细胞，但是仅局限于胚胎型神经元。萨克生物研究所Jerome Mertens和他的同事采集不同年龄的捐助者的皮肤细胞，将其培养成神经元细胞，且保留着老化的状态。这项技术为研究大脑衰老、老年化疾病开辟了新途径，有助于研发出前所未有的治疗药物。
Single Cell RNA-Sequencing of Pluripotent States Unlocks Modular Transcriptional Variation
最近，Wellcome Genome Campus的一项新研究演示了单细胞基因组学的力量，揭示了它如何能帮助科学家了解细胞的早期发育。这项研究发现了参与干细胞调控网络的新基因，以及新的细胞亚群，可让我们深入了解干细胞多能性——成为几乎所有不同类型细胞的能力。研究人员还为干细胞群落开发了新的资源，这将有助于解释未来的调查。
Small Molecules Efficiently Reprogram Human Astroglial Cells into Functional Neurons
来自宾夕法尼亚州立大学的华人科学家在国际学术期刊cell stem cell上发表了一项最新研究进展，他们利用小分子化合物成功地将神经胶质细胞重编程为具有功能的神经元细胞。
研究人员利用一组小分子化合物成功地将培养的人类星形胶质细胞变为功能完全的神经元细胞。他们利用由九种小分子组成的化合物组合按顺序先后处理人类星形胶质细胞，结果发现这种处理能够抑制神经胶质细胞，但会激活神经信号通路，并且在8-10天内成功地将星形胶质细胞重编程为神经元细胞。
The Cancer Stem Cell Niche: How Essential Is the Niche in Regulating Stemness of Tumor Cells？
癌症干细胞是具有自我更新能力，也就是干性的癌细胞，研究人员已经在越来越多的肿瘤中分离和鉴定到了癌症干细胞，比如结肠癌、肝癌、乳腺癌和胰腺癌。对于癌症干细胞来说，微环境调控十分重要，这些环境能帮助维持癌症干细胞的基本特征，保持其表型可塑性，并保护其免受免疫系统的攻击，而且还可以促进其转移。
Cell Stem Cell杂志发表了题为“The Cancer Stem Cell Niche: How Essential Is the Niche in Regulating Stemness of Tumor Cells?”的综述文章，聚焦于癌症干细胞微环境，并探讨这对肿瘤的发生和发展的影响。由于癌症干细胞能逃过许多常见癌症治疗方法，因此这篇文章也指出这些微环境中的元件也许就是目前癌症治疗的新靶标。
Coordination of m6A mRNA Methylation and Gene Transcription by ZFP217 Regulates Pluripotency and Reprogramming
西奈山伊坎医学院的研究人员鉴定了一种控制干细胞性能的关键蛋白，可以提高它们在再生医学中的实用性。这项研究发表在十月二十九日的Cell Stem Cell杂志上。
将干细胞用于临床治疗，需要严格控制其多能性（分化为其他细胞类型的能力）和自我更新（持续分裂和增值的能力）。研究人员发现，锌指蛋白217（ZFP217）控制着干细胞自我更新和分化之间的平衡。
Direct Lineage Reprogramming: Strategies, Mechanisms, and Applications
这篇文章为邓宏魁教授的综述：文章盘点了研究者们新发现的谱系重编程因子和重编程机制，介绍了生成功能性成熟细胞的 新策略以及分析谱系重编程细胞的新方法。除此之外，作者们还探讨了谱系重编程应用方面取得 的新进展，以及这一策略未来所面临的主要挑战。
Histone Demethylase Expression Enhances Human Somatic Cell Nuclear Transfer Efficiency and Promotes Derivation of Pluripotent Stem Cells
来自哈佛医学院、美国CHA健康系统的研究人员证实，表达组蛋白去甲基化酶可提高人类体细胞核移植的效率，促进多能干细胞分化。
研究人员证实像在小鼠中一样，人类体细胞基因组中的H3K9me3是SCNT重编程的一个障碍，过量表达相关H3K9me3去甲基化酶KDM4A可以改善人类SCNT。他们证实，过表达KDM4通过促进转录重编程大大提高了人类SCNT胚胎中的囊胚形成率。研究人员利用年龄相关黄斑变性(AMD)患者的体细胞供体核，实现了SCNT源性ESCs的有效分化。
新研究发现对于在包括再生医学在内的各种情况下改善SCNT均具有广泛的潜在应用前景。
Single-Cell RNA-Seq with Waterfall Reveals Molecular Cascades underlying Adult Neurogenesis
宋红军，明国丽研究组采用单细胞RNA测序获得了成体海马静息神经干细胞(qNSCs)和它们的直接后代细胞丰富的单细胞转录组资源。他们进而开发出了一种叫做Waterfall的生物信息学流程，沿着重新建立的连续的发育轨迹统计量化单细胞基因表达。由此揭示出了成体qNSCs的一些分子特征：其具有积极的微环境信号整合能力，但其蛋白质翻译能力较低。分析结果进一步描绘出了qNSC激活及启动神经发生潜在的分子级联反应，比如外部信号传导能力下降及翻译能力提高，预处理的翻译机器，转录因子的调控开关，代谢及能量来源。
这一研究揭示出了成体神经发生潜在的分子级联反应，并演示了如何利用Waterfall来对各种连续的生物学过程进行单细胞组学分析。
