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m6A RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成研究(二)

2020.4.20

接着,作者对同类型样本进行了m6A CLIP测序,对三个样本分别进行motif分析后,发现三者共有将近有11,000个序列为GGACU的peaks(图5 c)。将peak分别于转录本和基因组比对后,发现与YTHDF1 CLIP的结果十分类似(图5 d,e)。对两次CLIP实验的peaks取交集后,发现共有将近30%的peak(图5 g),IGV结果表明:YTHDF1的m6A位点与突触形成关键蛋白(如Gira1,Grin1和Camk2a等)的m6A位点相近,二者可能通过m6A位点结合,调控蛋白的合成(图5 h)。

5. 首次绘制电休克小鼠的m6A RNA甲基化谱

最后,作者建立了电休克小鼠模型,对海马体的齿状回结构的组织进行m6A RNA甲基化测序和转录组测序联合,快速找到许多既发生m6A 甲基化表达量又发生巨大变化的基因,以供后续研究。

总结:

本篇文章表明小鼠海马体中m6A RNA甲基化能够调控学习和记忆的生成,并且可以影响调控与神经形成相关的关键靶基因的表达,为今后进一步研究m6A修饰在学习和记忆分析机制提供了认识。

何川教授m6A RNA甲基化Reader相关蛋白成果总结:

1. 2013.11 Nature IF: 41.58

带有YTH结构域的结合蛋白通过mRNA结合影响功能。

2. 2014.5 Nature IF: 41.58

讲明Reader蛋白的作用机制。

3. 2015.2 Nautre IF: 41.58

揭示m6A 甲基化结合蛋白HNRNPC与LncRNA结合的生物学功能。

       

4. 2017.4 Cancer Cell IF: 22.84

揭示m6A甲基化结合蛋白HUR与LncRNA结合的生物学功能。

参考文献:

1. Hess, M. E. et al. The fat mass and obesity associated gene (Fto) regulates activity of the dopaminergic midbrain circuitry. Nat. Neurosci. 16, 1042-1048 (2013).

2. Weng, Y.-L. et al. Epitranscriptomic m 6 A regulation of axon regeneration in the adult mammalian nervous system. Neuron 97, 313-325.e6 (2018).

3. Li, L. et al. Fat mass and obesity-associated (FTO) protein regulates adult neurogenesis. Hum. Mol. Genet. 26, 2398-2411 (2017).

4. Lein, E. S. et al. Genome-wide atlas of gene expression in the adult mouse brain. Nature 445, 168-176 (2007).


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