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利用 BIAcore 分析相互作用的蛋白质

2020.8.10

试剂、试剂盒 EDC氨基乙醇ExtracleanHEPES 缓冲的盐水缓冲液HClNHS小鼠抗-TSH 单克隆抗体兔抗小鼠-Fc 结构域TSHTSH 稀释液

仪器、耗材 BIAcore 仪器CM-5 传感芯片

实验步骤

第一阶段  捕获表面的制备和结合试验


材料


缓冲液和溶液

将贮存溶液稀释到适当的浓度。


EDC[0.2mol/L 的 N-乙基-N'-(二甲氨基丙基)-碳化二亚胺的水溶液]


氨基乙醇(1ml/L 盐酸乙醇胺,用 NaOH 调节至 pH8.5)


Extraclean

Extraclean 是一种用于表面再生的溶液, 可由 BIAcore 购得。


HEPES 缓冲的盐水缓冲液

10 mmol/L HEPES(pH7.4)

150 mmol/L NaCl

3 mmol/L EDTA

0.005%(V/V) 吐温-20

该缓冲液可以从 BIAcore 购得。


HCl(20 mmol/L)


NHS(0.05 ml/L 的 N-羟基琥珀酰亚胺水溶液)

EDC, 氨基乙醇以及 NHS 是由 BIAcore 购得的 Amine-coupling Kit 中的一部分


抗体




小鼠抗-TSH 单克隆抗体(lmg/ml,溶于 HEPES 缓冲盐水)

该抗体可以从 Alexon Trend,Inc. 购得。


兔抗小鼠-Fc 结构域 (RAMc)(30ug/ml, 溶于 l0 mmol/L 的 pH5.0 醋酸钠溶液)

该抗体可以从 BIAcore 购得。


TSH(20umol/L,溶于 HEPES 缓冲盐水)

TSH 可以从 Alexon Trend,Inc. 购得。


专用装置


BIAcore 仪器

该仪器包括 BIAcore 控制软件和 BIA 评价软件。

设备和软件可以从 BIAcore,Inc. 购得,相关的信息可査阅 www.biacore.com。


CM-5 传感芯片


方法


RAMc 通过伯氨基与 CM-5 传感芯片表面的结合

这一步要用约 45 min。通过下拉菜单或 BIAcore 控制软件工具栏中的图标来执行操作命令。


1. 将 CM-5 传感芯片模块嵌入 BLAcore 仪器。


2. 全部采用过滤并除气的 HEPES 缓冲盐溶液。


3. 将分别含有 NHS、EDC、乙醇胺和 RAM Fc 以及 20 mmol/L HCl 各 100 的小管置于 BIAcore 自动进样器架的适当位置。


4. 将一个空管置于 BIAcore 自动进样器架上。

如果采用的是 Immobilization Wizard,则可以进行这一步。(Wizards 是 BIA2000 和 BIA3000 中 BlAcore 控制软件 3.0 版本或更高版本的标准配制。)使用 Wizard 的话,按规定体积添加样品。结合 RAM Fc 的 RUs 目标数为 13000。


5. 开动仪器,以 5ul/min 的流速流过一个流动池。


6. 将 75ul 的 NHS 加入到一个空管中。


7. 在同一管中再加入 75ul 的 EDC。


8. 将含有 NHS 和 EDC 的小管中的成分混匀。


9. 注射 35ul NHS/EDC 混合物使表面活化。


10. 注射 35ul RAM Fc 到活化表面与抗体结合。


11. 注射 35ul 乙醇胺使过量的反应基团失活。


12. 快速注射 10ul 的 20 mmol/LHCl, 然后用 Extradean 除去非共价结合型材料。


13. 通过在开始注射 RAMc 前放置一个基线报道点,并在注射 20 mmol/L HCl 结束后 2 min 放置第二个报道点,来测定结合 RAMc 的水平。

固定 RAMc 的最终 RUs 值应该介于 10000 到 13000 之间;如果所得值偏低,可能是由于所用的 RAMc 浓度太低,或使用了贮存期超过 2 个月的 NHS 或 EDC 溶液。RAMc 的 RUs 值较低的表面仍然可以使用,但抗 TSH 的体积必须按经验进行调整;通常地,需要更多的抗-TSH 以达到期里的结合水平。


14. 关闭流动液,关闭命令窗口,保存报道文件。

在这时 BIAcore 可以处于预备(继续)状态,也可以在下一阶段直接使用表面。当缓冲液在仪器内保持流动时,RAMc 表面在机器里是非常稳定的。另外,芯片也可以拿出来保存在 4°C、含有少量水的 50 ml 锥形管中;以这种方式保存时表面可以稳定凡个星期。

检测抗-TSH 与 RAMc 表面的结合这一步要用约 20 min。通过下拉菜单或 BLAcore 控制软件工具栏中的图标来执行操作命令。


15. 开动仪器,使含有结合 RAMc 的流动池的流速为 10ul/min。


16. 注射 10ul 的 2ug/ml 抗-TSH(这需要总共 40ul 的抗-TSH 溶液)。

10ul 的抗-TSH 可以提髙约 250 个 KUs。如果 RAMc 表面的结含不能达到这种水平,再生(见第 17 步)并重复注射不同体积的抗-TSH,直至确定所需的注射体积。


17. 快速注射 10ul 的 20 mmol/L HCl,然后用 Extraclean 再生 RAMc 表面。


18. 为了测定结合到 RAMc 表面的重现性,用可以与抗 TSH 结合引起 250RUs 所需的体积重复注射抗 TSH。


19. 快速注射 10ul 的 20 mmol/L HCl,然后用 Extradean 再生 RAMc 表面。


20. 关闭流动液体,关闭命令窗口,保存报道文件。

检测 TSH 与捕获抗-TSH 表面的结合

这一步要用约 20 min。通过下拉菜单或 BIAcore 控制软件工具栏中的图标来执行操作命令。


21. 开动仪器,使含有结合 RAMc 的流动池的流速为 10pl/min。


22. 注射 10ul 的 2ug/ml 抗-TSH(或者注射第 15~20 步所测得的、与抗-TSH 结合引起 250RUs 所需的体积)。


23. 注射 25ul 的 200nmol/LTSH, 限定 120s 的解离时间(这需要总共 65ul 的 TSH 溶液)。120s 的解离时间就可以测得抗原-抗体复合物解离的速率。

注射约 20ul 的 200nmol/LTSH 以后,曲线会变平(斜率达到零),表示在抗原和抗体分于间的相互作用达到瞬时稳态。如果曲线没有变平,就再生表面,并将第 23 步中 TSH 的浓度改为 400nmol/L 后,重复第 21~23 步(见图 18-26 和图 18-27)。


24. 快速注射 10ul 的 20 mmol/LHCl, 然后用 Extraclean 再生 RAMc 表面。


25. 关闭流动流,关闭命令窗口,保存报道文件。





第二阶段  抗原-抗体相互作用的动力学分析


材料


缓冲液和溶液

将贮存溶液稀释到适当的浓度。


HEPES 缓冲的盐水缓冲液或适当的冲洗缓冲液

10 mmol/LHEPES(pH7.4)

150 mmol/LNaCl

3 mmol/LEDTA

0.005%(V/V) 吐温-20

该缓冲液可以从 BIAcore 购得。


抗体


小鼠抗-TSH 单克隆抗体(lmg/ml, 溶于 HEPES 缓冲盐溶液)

该抗体可以从 Alexon Trend,Inc. 购得。

将抗体稀释到 2ug/ml 并制备 1000ul 或所需体积)来达到第一阶段第 15~20 步所测得的目标共振单位。


TSH(20umol/L,溶于 HEPES 缓冲盐溶液)

TSH 可以从 Alexon Trend,Inc. 购得。


制备一系列注射用 TSH 稀释液:


1. 制备浓度为 200、100、50、25、10 以及 5nmol/L 的不同稀释液,每一份均溶于 280ul 的流动缓冲液中用于实验。

2. 每个浓度按每份 70ul 分装于四个 7 mm 塑料小瓶中,每个小瓶加盖。

3. 将小瓶按样品循环参数的指示放置在 BIAcore 管架的适当位置。


专用装置


BIAcore 仪器

该仪器包括 BIAcore 控制软件和 BIA 评价软件。

设备和软件可以从 BIAcore,Inc. 


CM-5 传感芯片,按第一阶段的介绍与 RAMc 结合。


方法


下列程序由三种方法模块或小段所组成:主程序、定义分析程序(DEFINEAPROG) 以及定义样品。注意一共有四个定义分析程序模块,在这四个程序中每一个均代表了主程序中的一部分(模块 1、模块 2、模块 3 以及模块 4)。当用软件编辑一个方法时,方法命令应釆用大写字母书写,用户所定义的参数用小写字母书写。


后跟感叹号(!)的部分注释仪器会认为是文字而非命令代码,会插入解释前一条命令的含义。


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