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琼脂糖凝胶电泳原理

2021.1.17

  琼脂糖凝胶电泳原理

  琼脂糖凝胶电泳,是以琼脂糖为介质,对不同大小的DNA 或 RNA 实现分离的一种电泳方法。琼脂糖是一种多糖,具有亲水性,但是不带电荷。

  使得 DNA 在碱性条件下使其带负电荷(pH8.0 的缓冲液),在电流作用下,以琼脂糖凝胶为介质,由负极向正极移动,根据不同的 DNA 分子片段的大小和形状不同,在电场中泳动的速率也不相同,同时在样品中加入染料(如EB或花青素类染料)能够和DNA 分子间形成络合物,经过紫外照射,可以看到 DNA 的位置(比对 marker 可知分子量大小),从而达到分离、鉴定的目的。

  琼脂糖凝胶电泳步骤

  1. 用蒸馏水将制胶工具洗干净,准备好制胶平板,用琼脂将模具边缘封闭,架好梳子;

  2. 根据要分离的样品(DNA)大小配制合适浓度的琼脂糖凝胶。准确的称取一定量的琼脂糖干粉,加入到合适体积的锥形瓶中,加入一定量的电泳缓冲液(30ml 左右TAE);放入到微波炉内加热融化,冷却片刻(不烫手即可);

  3.融化后的琼脂溶液摇晃混匀,倒入电泳槽中,等其凝固;

  4. 室温下凝固30-40min左右,小心的拔出梳子,取出凝固好的凝胶放入电泳槽内,准备上样;

  5. 在电泳槽中倒入电泳缓冲液(TAE);没过胶面 1mm左右,去除胶孔内的气泡;

  6. 上样,5ulDNA 样品加入 1ul上样缓冲液(loading buffer)和 1ul的染料,用抢混匀后加入到凝胶孔内; 7. 上样结束,接通电源,红色正极,黑色负极,DNA 样品有负极往正极运动,加样孔侧为负,,40-50v 电

  压,电压 30敏左右即可(<40min);

  8. 电压结束,关闭电源,凝胶成像仪上观察电压位置并比对marker 判断大小。


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