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位点特异重组的重组机制介绍

2022.11.10

  位点特异性重组本质上是两个重组位点的四股DNA发生两次切割和两次连接的过程,所需的关键成分是重组酶( recombinase),此外还需要一些蛋白因子。这里以入噬菌体DNA与大肠杆菌DNA整合而进入溶原状态为例,介绍位点特异性重组机制(图2-33)。

  1.第一次切割重组酶(又称入噬菌体整合酶,integrase,356AA,由入噬菌体基因组编码)四聚体与两个重组位点(入噬菌体重组位点attP和大肠杆菌重组位点au,B有15bp相同的核心序列)结合,切断两个重组位点一股DNA特定的磷酸二酯键,形成两个切口,切口3’端的磷酸基与重组酶活性中心Tyr342的羟基以磷酸酯键结合。

  2.第一次连接两个切口的5 7端交换,与对方3’端连接,形成HoUiday结构。

  3.第二次切割重组酶切断两个重组位点另一股DNA特定的磷酸二酯键,形成两个切口。切口3 7端的磷酸基与重组酶活性中心Tyr342的羟基以磷酸酯键结合。

  4.第二次连接两个切口的5’端交换,与对方3’端连接,Holliday结构解离。

  有些位点特异性重组体系的两个重组位点的四股DNA可能同时切割,同时连接,并不形成Holli-day结构。

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