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青海省重大专项“三江源区代表性动物基因资源保护与应用”通过验收

2023.11.07

  10月26日,由中国科学院西北高原生物研究所主持完成的青海省重大科技专项“三江源区代表性动物基因资源保护与应用”项目通过验收。该项目由中国科学院西北高原生物研究所、动物研究所、昆明动物研究所和青海大学相关团队共同参与完成。

  该项目聚焦三江源国家公园动物多样性保护的重大科技需求,综合利用第二代、第三代基因组测序及染色体构象捕获技术,完成了19种青藏高原典型动物高质量参考基因组的组装;重点解析了雪豹、野牦牛、藏野驴和高原鱼类四个代表动物的种群动态历史和演化特征;综合利用比较基因组学和生物信息学等大规模数据分析平台,深度挖掘了高原动物适应寒冷等极端环境的基因资源,搭建了青藏高原动物基因组数据库平台,截至项目验收,数据库共收录动物基因组数据超过10TB,存储动物组织、细胞等样品3.26万份,为三江源动物功能基因鉴定和基因资源利用提供了技术保障。该项目为相关部门提交重大决策咨询建议3项,发表高水平论文26篇,出版专著2部,培养和引进人才9名(国家级人才2名),培养研究生27名。

  以“三代+二代+Hi-C”策略,该项目构建了野牦牛和家牦牛染色体水平高质量参考基因组,结合多组学数据发现了牦牛适应青藏高原极端环境的新机制。相关成果发表在《自然-通讯》(Nature Communications)上,同时被《科学》(Science)和新华社等报道。研究通过雪豹参考基因组及种群重测序数据发现,青藏高原存在南北两种雪豹亚型,与其猎物分布较为一致,为青藏高原物种遗传多样性及适应提供了新见解。此外,该团队发现高原鱼类演化历史与青藏高原地质事件相关,濒危鱼类经历发全基因组复制,加倍基因主要富集于DNA修复、转运等与高原环境适应相关通路,这将有助于进一步探讨高原鱼类的适应性进化,并为鱼类的耐逆分子育种提供素材。

  此外,依托项目的相关成果,成立了青海省首家动植物损害鉴定机构——中国科学院西北高原生物研究所司法鉴定所。

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