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Scientific Reports:创建首个全面基因组图谱

2019.7.10

  近日,澳大利亚加文医学研究所的研究人揭示身体不同部位脂肪积聚所造成的伤害的驱动因素。他们的一项新研究比较了皮肤下的脂肪细胞和腹部内的有害脂肪,创建了第一个全面的基因组图谱。该图谱揭示了在细胞发育早期独特的特征,不同类型的脂肪似乎“硬捆绑”(hard-wire)在一起。该研究发表于Scientific Reports。DOI:10.1038 / s41598-019-45777-w

  加文医学研究所基因组学研究主任Susan Clark教授表示:“细胞的表观基因组可以让我们对脂肪细胞的发育过程有更深入的了解。这项研究为我们提供了一个全新的视角,这让我们看到了促进细胞发育的潜在因素,而这些细胞可能会带来重大的健康风险。”

  给你的脂肪分类

  脂肪细胞对人体代谢与内分泌至关重要。人体有两大天然的脂肪存储库,根据脂肪所在的位置不同,于是便有了内脏脂肪与皮下脂肪的概念。

  也正是因为脂肪细胞所在的位置不同导致了脂肪对人体造成的影响也不同。内脏脂肪主要位于腹部,集结于肝脏、肠胃附近。内脏脂肪累积过多会导致炎症和代谢紊乱,并且与2型糖尿病和心脏病等并发症有关。而皮下脂肪在皮肤表层下方以存储能量调节体温,通常情况下是无害的。

  这不由让人质疑:同样是脂肪细胞为何对人体影响差异这么大?

  基因图谱揭秘脂肪功能差异

  研究人员从BMI(身体质量指数,Body Mass Index)正常的个体内脏和皮下脂肪活组织切片中分离出储存脂肪的细胞。研究小组全面地比较了每个转录组和DNA甲基化组,以确定表观遗传差异及其对细胞类型和存储特异性功能的影响作用。

  人类内脏和皮下脂肪细胞的甲基化组和转录组图揭示了发育基因的关键表观遗传差异

  通过创建全面的基因组图谱,研究人员发现一些基本的表观遗传学差异,这些差异与皮下脂肪和内脏脂肪细胞的基因表达变化有关。

  值得关注的是,这些差异在细胞发育的早期就出现了,而且很可能存在于脂肪细胞产生的前体细胞中。这一发现表明:尽管脂肪细胞外表相似,但脂肪细胞很早就“固定”下来,对人体有害或无害。

  也就是说并不是所有的脂肪细胞都是平等的,一些脂肪细胞已经在细胞分裂前期就注定对身体有益,可以说是赢在了起跑线上。

  解读脂肪的全新角度

  该研究论文的第一作者Stephen Bradford博士表示:“与人体其他细胞类型相比,内脏和皮下脂肪细胞的功能非常相似。我们的分析揭示了表观遗传差异,控制着皮下和内脏脂肪细胞中开启的不同基因可能导致它们具有不同性质,从而对健康对健康产生不同的影响。

  表观基因组可以提供一个前所未有的视角来研究细胞之间的差异。脂肪细胞看起来非常相似,但是我们相信,基因组图谱不仅对脂肪的发育,而且是对未来的其他细胞类型的关键性洞察。

  参考资料:

  [1] Genomic‘map’ reveals not all fat is equal

  [2] Methylome and transcriptome maps of human visceral and subcutaneous adipocytes reveal key epigenetic differences at developmental genes

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