一文了解sgRNA(向导RNA)
向导RNA(guide RNA,gRNA),也称为小向导RNA(small guide RNA,sgRNA)。是作用于动质体(kinetoplastid)体内一种称为RNA编辑(RNA editing)的后转录修饰过程中。也是一种小型非编码RNA。可与pre-mRNA配对,并在其中插入一些尿嘧啶(U),产生具有作用的mRNA。向导RNA编辑的RNA分子,长度大约是60~80个核苷酸,是由单独的基因转录的,具有3'寡聚U的尾巴,中间有一段与被编辑mRNA精确互补的序列,5'端是一个锚定序列,它同非编辑的mRNA序列互补。
gRNA介导的RNA编
在编辑时,形成一个编辑体(editosome),以gRNAs内部的序列作为模板进行转录物的校正, 同时产生编辑的mRNA。gRNA3'端的oligo(U)尾可作为被添加的U的供体。
原核生物及植物线粒体中进行RNA编辑所需的RNA序列,是与正确编辑的RNA序列互补的一小段RNA,被用来作为向未经编辑的RNA中插入碱基的模板。
gRNA的分子结构
(1)在gRNA的5‘末端有一段锚定区,以特殊的G-U配对方式与pre-mRNA编辑序列互补,锚定序列促进gRNA与pre-mRNA中的编辑区互补,特异结合;
(2)在gRNA分子的中间部位也有一个编辑区负责在被编辑的pre-mRNA分子中插入U的位置;
(3)在gRNA分子的3’末端,有一段转录后加入的由大约15个非编码的PolyU序列,功能为把gRNA链接到pre-mRNA的编辑区的5‘上游富含嘌呤碱基的核苷酸序列上。