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克隆经验:帮助新手快速做出克隆-2

2020.9.08

(提示 关于酶量的问题。通常的内切酶效价在10U/μL左右,3μL内切酶相当于30U,足够切10μL的质粒。因为通常小提质粒的浓度在200-600ng /μL,一般浓度达不到1μg/μL。根据1U酶切1μg质粒的原则,这一酶量是足够的。)
1%琼脂糖回收胶回收(碎胶、酚氯仿抽提法)

1. 酶切产物加入10%量的上样Buffer,混匀。使用1%的琼脂糖回收胶,电泳回收酶切产物。

2. 用手术刀切下所需要的大片断(载体)和小片断(插入片断),收入一个1.5mL离心管中。(提示: 切胶前,需用分别含酒精、NaOH和双蒸水的纸巾擦拭凝胶接触的台面,以防污染。 手术刀要火焰消毒,而后切胶回收。)

3. 12000rpm 1分钟,将凝胶甩到管底。 -20℃ 冰冻20分钟。

4. 取200μL Tip 头两只,在酒精灯上稍烤化Tip头尖端,两Tip头尖相对来回相接触,在Tip头顶部制成直径3mm左右的平头,准备用于碎胶。

5. 从-20℃取出冻结的凝胶,立即使用200μL枪套上平头Tip头,捣碎凝胶。(提示 200μL的枪足够粗壮,不要用100μL的枪,小心折断!!! 乘凝胶比较硬时就开始碎胶,轻而频率高地捣碎凝胶)

6. 凝胶管中加入500μL双蒸水,盖紧,振摇200下。

7. 加入500μL Tris饱和纯酚,盖紧,振摇200下。 12000rpm 4℃ 离心15分钟。

8. 在一新1.5mL 离心管中加入 500μL 氯仿:异戊醇(24:1),将步骤7的上清加入本步骤离心管中。盖紧,振摇200下。 12000rpm 4℃ 离心5分钟。

9. 在一新1.5mL 离心管中加入 900μL 预冷 无水乙醇、20μL 3M的醋酸钠。将步骤8的上清小心加入本步骤离心管中。颠倒数次混匀。12000rpm 4℃ 离心15分钟。(提示 吸取步骤8中的上清时,千万不要将有机相吸入,宁可放弃一些上清,否则影响后面的连接反应。 另外,本方法使用的醋酸钠量较小,但足够沉淀核酸,并且无需洗盐。)


10. 弃上清,将离心管倒置于干净吸水纸巾上5分钟。室温下吹风干燥。(提示 可将试管至于超净台吹风干燥。如果管底有较多液体聚集,可盖好管盖后,轻弹管底数次,将液体分散挂在管壁上,再打开管盖吹风。)

连接

向回收DNA的试管中加入8μL 双蒸水,盖紧,弹击管底使液体尽量接触管壁。瞬时离心将液体甩到管底,再加入1μL ligase Buffer,1μL T4 ligase(连接酶)。弹击管壁混匀,瞬时离心将液体甩到管底。 置4℃过夜。 (提示 Ligase Buffer应该在首次融解后分装,每管可2-3μL,-20℃存储。 4℃过夜可获得最多的转化克隆 。)

二、PCR产物接入质粒的克隆

简介: 取100μL PCR产物,酒精沉淀、干燥,直接加入酶切体系酶切;将用作载体的质粒A(制作大片断)酶切3μL;切胶回收来自质粒A的大片段,和来自PCR产物的小片断,并回收到一管中;酚氯仿法回收DNA,酒精沉淀,干燥;加入8μL水、1μLligase Buffer、1μL ligase ,4℃过夜;次日转化涂板。

PCR产物回收

1. 制备100μL PCR产物。

2. 将100μL PCR产物加入一1.5mL离心管中,再加入400μL双蒸水,颠倒混匀。加入 900μL 预冷 无水乙醇、20μL 3M的醋酸钠。颠倒数次混匀。(提示 本方法使用的醋酸钠量较小,但足够沉淀核酸,并且无需洗盐。)

3. 4℃静置30分钟,以利于核酸沉淀。

4. 12000rpm 4℃ 离心15分钟,沉淀核酸。

5. 弃上清,将离心管倒置于干净吸水纸巾上5分钟。室温下吹风干燥。(提示 可将试管至于超净台吹风干燥。如果管底有较多液体聚集,可盖好管盖后,轻弹管底数次,将液体分散挂在管壁上,再打开管盖吹风。)


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