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Cell杂志最受关注十篇文章（12月）
Cell创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。 Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主，许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为：
1. Hallmarks of Cancer: The Next Generation
Douglas Hanahan, Robert A. Weinberg
老牌明星论文，上榜无数次了，
由癌症研究泰斗：Robert A.Weinberg完成的最新癌症综述是之前他的一篇文章“The Hallmarks of Cancer”的升级版――之前那篇文章介绍了肿瘤细胞的六大基本特征，被称为肿瘤学研究的经典论文，到目前为止，这篇论文已经被引用了上万次。
2011年3月，Robert A.Weinberg同样是和Douglas Hanahan合作，完成长达29页的论文，简述了最近10年肿瘤学中的热点和进展，包括细胞自噬、肿瘤干细胞、肿瘤微环境等等，并且将原有的肿瘤细胞六大特征扩增到了十个，这十个特征分别是：
自给自足生长信号(Self-Sufficiency in Growth Signals);抗生长信号的不敏感(Insensitivity to Antigrowth Signals);抵抗细胞死亡(Resisting Cell Death);潜力无限的复制能力(Limitless Replicative Potential);持续的血管生成(Sustained Angiogenesis);组织浸润和转移(Tissue Invasion and Metastasis);避免免疫摧毁(Avoiding Immune Destruction);促进肿瘤的炎症(Tumor Promotion Inflammation); 细胞能量异常(Deregulating Cellular Energetics);基因组不稳定和突变(Genome Instability and Mutation)。
2. Transcriptional Silencing of Transposons by Piwi and Maelstrom and Its Impact on Chromatin State and Gene Expression
Grzegorz Sienski, Derya Dönertas, Julius Brennecke
来自奥地利维也纳分子生物技术研究所的研究人员发现了转座子和piRNA对染色质模式，以及基因表达的广泛影响，对于未来深入探索这一沉默途径，以及染色质状态基因表达具有重要的意义。
研究人员发现了果蝇中，Piwi介导的沉默途径的一种新作用因子：HMG蛋白Maelstrom，这一蛋白是Piwi沉默途径中的必须元件。
研究人员通过全基因组分析发现了RNA聚合酶II的聚集，以及新合成RNA的输入，以及在缺失Piwi或Maelstrom时转座子稳定RNA水平之间的密切关联，这表明piRNA介导的上百个转座子的反沉默(trans-silencing，生物通译)是在转录水平上拷贝的。
而且研究人员也指出Piwi对于转座子和基因组环境中建立异染色质H3K9me3标记也十分重要，如果丢失Maelstrom，虽然只会轻微影响到转座子 H3K9me3模式，但是却会造成异染色质广泛传播，这说明Maelstrom具有与H3K9me3平行，或者处于下游的功能。
这些研究数据表明了转座子和piRNA对染色质模式，以及基因表达的广泛影响，对于未来深入探索这一沉默途径，以及染色质状态基因表达具有重要的意义。
3. Daddy Issues: Paternal Effects on Phenotype
Oliver J. Rando
4. Nuclear Aggregation of Olfactory Receptor Genes Governs Their Monogenic Expression
E. Josephine Clowney, Mark A. LeGros, Colleen P. Mosley, Fiona G. Clowney, Eirene C. Markenskoff-Papadimitriou, Markko Myllys, Gilad Barnea, Carolyn A. Larabell, Stavros Lomvardas
嗅觉受体基因的核聚集可控制单基因表达
5. Revisiting Global Gene Expression Analysis
Jakob Lovén, David A. Orlando, Alla A. Sigova, Charles Y. Lin, Peter B. Rahl, Christopher B. Burge, David L. Levens, Tong Ihn Lee, Richard A. Young
研究人员报道，在当前许多各种不同的生物学研究中，用于产生和理解全局基因表达分析数据的常见假设能够导致关于基因活性和细胞行为方面严重缺陷性的结论。
今天对基因表达数据的大多数理解都依赖于一种假设：用来分析的所有细胞拥有类似的mRNA总量，其中mRNA大约占细胞RNA中的10%，作为蛋白合成的蓝图发挥作用。然而，一些细胞，包括恶性癌细胞，要比其他细胞产生几倍多的mRNA。传统的全局基因表达分析通常忽略这些差别。
这篇新研究在研究表达高水平c-Myc的癌细胞的基因表达时揭示出这种缺陷。已知c-My是一种基因调节物，在恶性癌细胞中高度表达。当比较表达高水平c- Myc的细胞和表达低水平c-Myc的细胞时，他们吃惊地发现不同的基因表达分析方法能够产生显著性的不同结果。进一步的研究揭示出在含有高水平c- Myc的和低水平c-Myc的细胞中存在显著性的不同，不过这些不同利用常见使用的实验方法和分析方法来掩盖掉。
6. MED12 Controls the Response to Multiple Cancer Drugs through Regulation of TGF-β Receptor Signaling
Sidong Huang, Michael Hölzel, Theo Knijnenburg, Andreas Schlicker, Paul Roepman, Ultan McDermott, Mathew Garnett, Wipawadee Grernrum, Chong Sun, Anirudh Prahallad et al.
研究人员发现了引起对许多癌症药物耐受的一个关键基因。这一研究揭示了一个生物标记物，可以预测对于癌症药物的反应，提供了一种基于它们的遗传标记治疗耐药性肿瘤的新策略。
研究小组开发了一种筛查方法鉴别哪些基因抑制赋予了非小细胞肺癌细胞对crizotinib的耐药性。他们发现了癌症中发生突变的一种基因MED12，它的抑制不仅可导致对crizotinib耐药，而且造成了用于治疗各种类型癌症的其他靶向性药物和化疗的耐受。
研究人员还发现MED12抑制是通过增强转化生长因子β受体(TGF-betaR)这一与细胞生长和死亡相关的蛋白质信号引起了耐药性。在MED12缺陷细胞中抑制TGF-betaR信号，可使它们恢复对药物的反应。结果表明当前在临床试验中测试的TGF-betaR抑制剂或可对抗MED12突变癌症患者的耐药性。
7. Facilitators and Impediments of the Pluripotency Reprogramming Factors" Initial Engagement with the Genome
Abdenour Soufi, Greg Donahue, Kenneth S. Zaret
一个科学家小组开展了一些细致的检测研究，更深入地了解了iPS细胞的形成机制，并找出了Yamanaka的重编程程序效率低下的原因。研究揭示了iPS细胞形成的一些细胞障碍，如果克服它们可以大大提高iPS细胞生成的效率和速度。
这些研究提供了详细的见解，重编程因子如何与分化细胞染色质相互作用，启动它们沿路向干细胞转变，研究还鉴别了染色质中一个重要的结构性障碍，重编程因子必须克服这一障碍才能结合DNA。这一知识将有助于提高重编程的效率，这对于未来的治疗应用非常重要。
8. FOXP2 and Human Cognition
Philip Lieberman
9. SnapShot: Telomeres and Telomerase
Andrea J. Berman, Thomas R. Cech
10. Induction of Pluripotent Stem Cells from Mouse Embryonic and Adult Fibroblast Cultures by Defined Factors
Kazutoshi Takahashi, Shinya Yamanaka
这篇是今年诺贝尔生理/医学奖得主山中伸弥的代表作，这篇论文中，山中伸弥等人首先用4个干细胞转录因子OCT4、SOX2、KLF4和c-MYC, 通过体细胞重编程将小鼠成纤维细胞转化成具有胚胎干细胞特征的iPS细胞。这才有了其后的iPS陆续研究成果。
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