优化蛋白质组学中膜蛋白的溶解性
据来自最近的研究，“在疾病的分子标志物和药物开发中，的组是至关重要的。然而，在这一领域的进展缓慢，主要来源于用分析膜蛋白非常困难。”
他说：“这项调查的目的是探讨和优化溶解膜蛋白的方法，用于CD14人单核的鸟枪法膜蛋白质组的研究。研究比较了几种体系：
i）纯有机相（甲醇）
ii）酸敏性洗涤剂3-[3-(1,1-bisalkyloxyethyl)pyridin-1-yl) propane-1-sulfonate (PPS)；
iii）两种溶剂的混合（甲醇＋PPS）。
首先比较了不同缓冲液的增溶效率，使用噬菌调理素bacteriorhodopsin作为膜蛋白的模型，在与FACS分析的CD14表达有98%正相似的、高度富集的人单核细胞群系中的膜蛋白亚蛋白质组（subproteome）上，应用比较了这些方法。结果表明，基于甲醇的缓冲体系溶解后，可测定194个蛋白，其中的93个（48％）是膜本体蛋白质（integral membrane proteins）；使用甲醇和酸裂解剂的混合溶液给出相似的结果，测定了203个蛋白，其中的93个（46％）是膜本体蛋白质；而单独使用PPS，测定了216个蛋白，其中的75个（35％）是膜本体蛋白质。” SAIC-Frederick公司的X.Y. Ye 和其同事在文章中写到。
研究者们总结道：“这些结果表明，使用甲醇或甲醇＋PPS的缓冲体系，比PPS溶解，可显著获得更多的膜蛋白用于鉴定/富集。”
Ye和同事们发表了他们的结果在：Optimization of protein solubilization for the analysis of the CD14 human monocyte membrane proteome using LC-MS/MS. Journal of Proteomics, 2009;73(1):112-122
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