指肾小球毛细血管网内的血浆成分向肾小囊腔滤过。滤过的动力是肾小球的有效滤过压，滤过的结构基础是滤过膜，由肾小球毛细血管的内皮细胞、基膜和肾小囊脏层上皮细胞（又称足细胞）构成。人的滤过膜厚约325纳米（nm），其中内皮细胞和足细胞层各厚约40纳米。内皮细胞上有分布规整的窗孔，孔径50～100纳米，窗孔总面积占毛细血管总面积的5～10%，而肌肉毛细血管窗孔总面积占毛细血管总面积的0.2%，故前者的通透性比后者大100倍或更多。基膜是由水合凝胶组成的微纤维网，网孔隙4～8纳米，伸展性较大。

足细胞是有突起的细胞，从胞体伸出初级突起，再由后者伸出次级突起，与相邻足细胞的突起形成指状交叉，突起间的裂隙称裂孔，孔径25纳米，上覆有一层薄膜称裂隙膜，是物质滤过的最后一道屏障。滤过膜的结构像多层筛，具有一定的通透性又构成滤过膜的机械屏障，限制大分子物质通过。