肿瘤NGS大panel检测的标准化及研究进展（四）
位点检测准确性评价：设置了TMB-14号样本，参考测序仪性能评价参考品的标准的高置信SNP/indel位点的建立方法进行了TMB-14样本中两种细胞系的全基因组测序。然后构建了一个高置信参考变异集。
位点检测准确性评价过程。
同时，需要考虑临床样本panel和WES一致性评价，在真实肿瘤样本中，根据不同的建模方式，将panel TMB值代入回归方程中，看是否落在90%的预测区间中，来证明临床样本panel和WES的一致性。建议多准备点样本，中检院要求准确性＞90%，所以至少要准备15份样本。
需要考虑和具有临床药效样本检测一致性评价，进行TMB标准数据库构建计划。
1，临床样本的标准WES数据；
2，肺癌突变与临床疗效结果具有相关性；
3，确定测序数据质控和分析基本参数要求。
TMB计算规则建立及验证全程中的质量控制标准化：
1，下机数据质控；
2，panel饱和度，计算规则验证；
3，参考品检测；
4，TMB数据一致性；
5，监管数据库复核。
TMB检测标准化困境或挑战：产品设计方面，TMB的cut-off值，设立及验证？产品预期用途是单药？联合用药？疗效预测？
标准化方面也有很多困境：不用肿瘤的阈值的标准化；不同算法的标准化；性能指标验证方法的可操作性。
bTMB也可以评估免疫治疗的效果，但存在标准不统一，评估数据较少的情况，也是未来的应用趋势。
目前，中国还没有基于肿瘤组织或血液的NGS大panel产品获批，不过相信随着NGS大panel检测的标准化发展和建立，将会有更多的基因检测公司参与到NGS大panel检测产品的注册申报中，亦有利于促进中国肿瘤精准诊疗行业的进一步发展。
参考资料：
1.Lyle, Stephen, et al. “Comparison of a Large NGS Panel to Hot-Spot Testing and Small Panels for the Ability to Accurately Stratify Advanced Colorectal Cancer Patients to Appropriate Treatment Pathways.” Journal of Clinical Oncology, vol. 34, 2016, pp. 510–510.
2.Büttner Reinhard,Longshore John W,López-Ríos Fernando et al. Implementing TMB measurement in clinical practice: considerations on assay requirements.[J] .ESMO Open, 2019, 4: e000442.
3.曲守方.,肿瘤大panel检测的标准化及研究进展申报中的思考，PPT，CSCO裕策博卫星会,20200924.
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