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新研究揭示DNA损伤后的组蛋白降解促进DNA修复

2021.8.29

几年来,Gasser及其研究团队一直在研究染色质结构如何在应对DNA损伤的过程中发生变化,以便了解这些变化是否以及如何提高修复速度。在早期的一项研究中,Gasser实验室的前博士生Michael Hauer发现,染色质对急性DNA损伤既有局部的反应,也有全基因组范围内的反应,大约30%的组蛋白在全基因组范围内被修饰、去除和降解,而且这种现象不仅仅是发生在损伤部位。这促使染色质在细胞核中的移动性更强。

论文作者、Gasser实验室博士生Anaïs Cheblal在这些发现的基础上,探究了这种染色质动态和分解的增加是否会通过同源重组影响DNA修复机制。

在这项新的研究中,Cheblal及其同事们强调,组蛋白降解和随后的染色质解压缩(chromatin decompaction)确实会提高DNA修复效率和动力学。Cheblal总结了这项研究的主要发现:“我们发现,DNA双链断裂可以通过组蛋白的受控降解引发异位的染色质解压缩[指的是在远处未受损的位点,而非局部],这对基于同源重组的DNA修复至关重要。我们还发现,局部断裂动态对DNA修复不那么重要,可以通过增加异位染色质移动来加以弥补,而异位染色质移动与染色质解压缩相关。此外,我们排除了之前的一个假设:染色体从核外周脱离是DNA损伤反应的一部分。”

当被问及这项研究的更广泛影响时,Cheblal说,“我们的研究将对CRISPR介导的基因疗法至关重要,目前这种疗法的效率太低,无法用于临床。我们的研究结果表明将这项技术与经过适当上调的因子结合起来诱导组蛋白降解,可能会提高CRISPR-Cas9的编辑效率。”

通过同源重组修复DNA是CRISPR-Cas9靶向基因组编辑的基本原理。CRISPR-Cas9编辑技术主要作为研究工具,但也用于基因治疗。初步研究表明,在哺乳动物细胞中,随着组蛋白的耗竭,CRISPR-Cas9的编辑效率可以提高

关于 牛血清产品 的概述

【牛血清】是细胞培养中重要的天然培养基,含有丰富的细胞生长必须的营养成份,常用于动物细胞的体外培养。

牛血清分为胎牛血清,新生牛血清,小牛血清,成牛血清。

 

【胎牛血清】(Foetal Bovine Serum,简称FBS):是采自5-8个月胎龄牛胚胎中的胎血。此时胎牛各脏器正处生长分化阶段,血中含有丰富的生长发育因子,非常适合各种细胞的培养,一旦胚胎发育完全这些因子自动消失。因此8个月胎龄以上的牛胚胎,已接近足月,不能作为胎牛血清的原料来使用。

 

【新生牛血清】(Newborn Calf Serum,简称NBCS):采自出生一天~一周内的新生牛;

 

【小牛血清】(Calf Serum):采自出生10-30天的小牛;

 

【成牛血清】(Adult Bovine Serum,简称ABS):采自成年牛收全血后分离得到血清。

所有血清出厂前均应经过严格质控,并附详细《检测报告》,

如pH值、渗透压、内毒素、病毒检测、促细胞生长能力、无菌等检查。

其中,由于内毒素直接参与细胞凋亡,对细胞培养结果影响较大,且不同批次的血清,内毒素差异又不易控制。

 

有下列情况者,对血清内毒素应格外留意筛选:

1.养干细胞时,干细胞对内毒素非常敏感,如果血清中内毒素≥3EU/ml时,干细胞很容易死亡。很多使用者,在血清在试用前,就通过提早审核该批次《检测报告》,以决定是否入围进行试用。

2.养免疫细胞时,过高的内毒素可诱导免疫细胞释放炎症因子,抑制小鼠红细胞集落的形成等。

3.基因敲除相关的细胞实验,培养的细胞要尽可能保持其原始状态,任何引导细胞衰老或凋亡的试剂,都会让后续的实验结果“失之毫厘,谬以千里”。在准备血清和其他试剂时,选择极低的内毒素(≤1EU/ml),对实验至关重要;

4.原代培养、杂交瘤融合、细胞转染,或者肝细胞、神经细胞、内皮等难养细胞的扩增,这些都需要挑选好的血清给细胞以有力支持。因此,挑选更低的内毒素,是保证实验顺利的开始。

5.实验室有些细胞,需要长期培养、长期冻存,或者经常复苏、经常培养的,血清会经常或长时间作用于细胞。为保证细胞的健康,都应该选用更低内毒素的血清,以避免内毒素长久对细胞的毒性影响。

 

总之,血清中内毒素含量过高,更容易导致细胞“亚健康”,造成数据不准,或细胞状态不良、老化、甚至死亡,导致试验中断失败。血清中的内毒素越低越好。

细胞培养学会均依据内毒素对血清的品质进行分级和命名。




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