卫星RNA的重组

在一些动物病毒中，存在着基因组之间的重组现象。发生重组的RNA可能具有同源性，也可能没有同源性。前一种情况下，交换重组的RNA发生在两者之中的相同位置而不会改变通读框架ORF；后一种情况下，交换重组的位置不确定，因而会影响到ORF。在植物病毒中，仅证明雀麦花叶病毒BMV存在着RNA基因组重组现象。

TCV是单股正链RNA病毒，TCV不同于其它动物和植物病毒之处在于它支持三种不同类型的线状小分子RNA的复制：

（a）卫星RNA；

（b）缺损干扰RNA来源于辅助病毒的序列；（3）嵌合RNA，其5’端为卫星RNA序列，3端则为缺损干扰RNA的序列。TCV卫星RNA也有一个小家族，卫星RNA-D(非毒性，194碱基)，卫星RNA-F (非毒性，231碱基)，而卫星RNA-C (356碱基)是一个毒性卫星RNA，与辅助病毒共同接种则引起许多不同种类的寄主产生严重症状。其5’端功能区与非毒性卫星RNA相似，3’端功能区则与TCV基因组3’末端类似，利用RNA-F与RNA-C构建嵌合卫星RNA的研究表明，3’端区决定卫星RNA毒性，尤其是集 中在卫星RNA同源区的AGCAGC重复序列处的小区域对卫星RNA的侵染性有关键作用。通 过对TCV相关卫星RNA及缺损干扰RNA（DIRNA）的研究，认为卫星RNA-C具有卫星RNA -D、F和DIRNA双重性质的卫星RNA。在实验中，给植物同时接种TCV卫星RNA-D及在5’端区有致死突变的RNA-C体外转录产物时，发生卫星RNA因重组而使毒性恢复的现象，这 种毒性恢复了的卫星RNA5’端与卫星RNA-D5’端相同，3’端与卫星RNA-C3’端相同。有学者分析了17个重组分子接头处的序列，发现这些序列是特异的，这是由于植物体内发生 的不等交换导致短序列的重复而形成的。30 %的卫星RNA重组体在交换位点处发生非模板 编码的核苷酸插入。有学者提出一种解释重组卫星RNA形成的模型，设想存在一种复制酶 , 该酶具有模板选择功能，可以在TCV正链及与病毒相关的RNA合成过程中识别特定的起始信号并与之相结合，开始复制，然后新合成的链与酶不解离，在复制一段或全长之后，从原 模板脱落下来，重新选择模板继续合成。因此，当酶先识别RNA-D上的原始位点，依模板合成一部或全长分子后，酶连同新生链与模板链解离，然后识别RNA-C上起始位点并结合，继续合成，这样便可以形成重组卫星RNA，同样，也解释了DIRNA及卫星RNA-DI多聚体的形成。