2003年，Pulsenet China在中国成立后，市CDC积极开展PFGE(脉冲场凝胶电泳)技术的建立、评估及应用工作。先后在本实验室建立霍乱、副溶、O157、沙门、宋内志贺氏菌、军团、流脑、金黄色葡萄球菌的PFGE分型技术，并完成技术人员的培训、作业指导书的编写、质量体系的建立；同时，建立了近2000株细菌的PFGE数据库，涉及霍乱弧菌、沙门菌、副溶血性弧菌以及军团菌。并在奥运会期间对散发报道的霍乱病例进行了特征型别簇的聚集分析。与此同时，市CDC还积极在区县疾控中心开展Pulse-net上海区域中心的建设工作。微生物实验室从2006年起，每年对区县疾控中心的微生物实验室进行技术培训，使区县实验室对PFGE技术有了一定的认识。目前已有4家区县实验室配备了开展此项工作的仪器设备，并在工作中逐步应用该项技术。

　　2010年8月，PulseNet China工作委员会专家组对市CDC微生物实验室进行了实验室现场认可与考核，给予了很高的评价，市CDC成为首家通过PulseNet China实验室认可的单位。