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中国新型冠状病毒的基因组序列

2020.2.04

  《自然》杂志2月3日发表了新型冠状病毒的基因组序列(论文:A new coronavirus associated with human respiratory disease in China),病毒样本系从一名曾在最先爆发疫情的海鲜市场工作过的患者体内分离得到。基因组分析显示,该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。

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  最近出现在中国武汉的一种严重呼吸道疾病现已传播到中国其他地区和其他几个国家,其中包括美国、德国和日本。首例患者于2019年12月12日被收治入院,调查发现武汉一家同时销售野生动物的海鲜市场是此次疫情的潜在来源。

  中国上海公共卫生临床中心、复旦大学公共卫生学院的张永振及同事研究了一名41岁的男性海鲜市场工人,其于2019年12月26日在武汉一家医院住院,表现出呼吸系统疾病症状,包括发烧、胸闷和咳嗽。联合使用抗生素、抗病毒药和糖皮质激素进行治疗,但患者表现出呼吸衰竭,治疗三天后病情无改善。

  作者对从患者收集的支气管肺泡灌洗液(肺分泌物)进行了基因组测序。他们鉴定出了一种新型病毒,并发现该病毒基因组与蝙蝠体内发现的SARS样冠状病毒有89.1%的核苷酸相似性。尽管从单个患者的分析中不可能得出该冠状病毒是当前疫情爆发原因的结论,不过作者的这些发现已被针对其他患者的独立调查研究证实。

  *该研究得到的序列可在NCBI的SRA数据库中找到(BioProject登记号为PRJNA603194)。病毒完整基因组已存入GenBank,登记号为MN908947。*


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