用于PCR的模板DNA制备实验——酚-氯仿法提取石蜡组织中DNA
模板 DNA 质量直接影响 PCR 结果,是 PCR 成功的关键之一。根据其检测对象(组织细胞材料)的不同,有不同的制备方法,常用的材料有石蜡切片、冰冻切片、血细胞、胸腹水等。
实验步骤 | 1. 10 mm 厚石蜡切片 10~15 张,置入消毒后的 1.5 ml Eppendorf 管中。 2. 脱蜡 二甲苯 1200 μl,9000 r/min,8 min×3。 3. 脱水无水乙醇 1200 μl,9000 r/min,5 min×3。 4. 打开 Eppendorf 管盖子,将其置于 37℃ 烤箱中干燥 1~2 h。 5. 加裂解液 100μl,混匀后加 20 mg/ml 蛋白酶 K 15~20 μl,终浓度 10 μg/ml 间隔振荡,55℃ 烤箱中过夜。 裂解液配制:1 mol/L Tris-HCl(pH 8.0)2 μl,0.5 mol/L(pH 8.0)EDTA 4 μl,10% SDS(pH 7.2)20 μl,加水至 100 μl。 6. 观察裂解液是否清亮,如不清亮,根据组织量补加蛋白酶 K 3~5 μl,继续消化至裂解液清亮。 7. 加 500 μl Tris 饱和酚,混合至乳状。 8. 10000 r/min 离心 10 min,小心吸取上清液。 9. 加酚和氯仿各 250 μl,混匀,10000 r/min 离心 5 min,小心吸取上清液。 10. 加氯仿 500 μl,混匀,10000 r/min 离心 5 min,取上清液。 11. 加 NaAc(乙酸钠,3mol/L,pH 6.0)70 μl,无水乙醇 700μl,混匀,-20℃ 保存 2 h。 12. 10000 r/min 离心 5 min,弃上清液。 13. 加 70% 乙醇 1 ml,混匀,清洗。 14. 10000 r/min 离心 3 min,弃上清液。 15. 开盖,倒置 Eppendorf 管,室温下干燥。 16. 加 TE 缓冲液(pH 8.0)20~40 μl,55℃,10 min 速溶,置于 -20℃ 冰箱中保存。 |
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