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布鲁克与合作伙伴联手打造前沿的4D蛋白质组学新方案

2021.11.22

  * 布鲁克与Cellenion达成合作协议,将cellenONE®样品制备系统与 timsTOF SCP系统联用,实现全自动单细胞4D-蛋白质组学非标记工作流程;

  * Seer的Proteograph™产品与timsTOF Pro 2和timsTOF SCP联合使用,可从人血浆样本鉴定超过3000个蛋白,实现深度、无偏差与快速蛋白组学分析;

  * 布鲁克与PreOmics达成合作协议,将新产品BeatBox用于timsTOF 4D-蛋白质组学,该新品可用于高通量和高效率的组织、生物切片以及细胞样本的匀浆。

  在第20届人类蛋白质组世界大会(HUPO)上,布鲁克(纳斯达克股票代码:BRKR)发布了基于timsTOF多组学平台的碰撞截面(CCS)增强的4D -蛋白质组学工作流程方面的重要进展。

  布鲁克蛋白质组学副总裁Gary Kruppa博士表示:“人们所熟知的蛋白质组学受限于样品制备复杂,从而难以实现自动化。我们很高兴宣布,布鲁克正在与行业领先的合作伙伴协作,在单细胞蛋白质组学、血浆蛋白质组学和组织蛋白质组学这三个关键领域实现更高效率与自动化的流程。”

  1、与Cellenion在4D单细胞蛋白质组学 (SCP) 方面的新合作

  布鲁克宣布与Cellenion达成合作协议,共同推广CellenONE单细胞分选和纳升分配自动平台。与Cellenion在非标记4D单细胞蛋白质组学 (SCP) 上的合作为timsTOF SCP用户提供了一站式解决方案。cellenONE是一种独特的单细胞分选和纳升分配技术,它对活细胞完整性干扰程度最小,能够从细胞悬浮液中实现高通量、自动分配单个细胞。它也非常适合反应物分散,为分离细胞提供微量样品制备方案。

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图1:cellenONE  -Isolate 96 single cells in a few minutes

  Cellenion首席执行官Holger Eickhoff博士说:“我们相信,我们专业的精确分配和平台技术能实现100%的单细胞分离,与布鲁克为单细胞组学而研制的timsTOF SCP质谱仪相辅相成。具备纳升分配ZL技术的cellenONE可以提供自动单细胞分选和微量样品制备,我们的共同用户也将从此项合作关系中受益。

  2、与Seer在无偏差、深度血浆蛋白质组学方面的合作进展

  由于蛋白质的丰度范围很广,很难检测到作为疾病生物标志物的低丰度蛋白质,因此对血浆蛋白质组的深入研究具有很大的挑战性。血浆蛋白质组学快速工作流程通常仅检测数百个蛋白质组,但去除高丰度蛋白质或分离血浆蛋白质的前处理流程成本高、耗时长且无法很好地扩大规模。将Seer的Proteograph™系统和 timsTOF平台组合使研究人员能够以前所未有的深度、规模和速度来更深入地研究血浆蛋白质组,同时可以在氨基酸水平上检测蛋白变化。“ Proteograph为血浆蛋白质组的研究提供了全新的方案,”布鲁克蛋白质组学副总裁Gary Kruppa说,“我们对timsTOF和Proteograph的合作所带来的机会感到十分兴奋。”

  “在最近提交的一项联合研究中发现, Proteograph™产品与timsTOF SCP联用,仅需 60 分钟就可以对单针人源混合血浆样本定量3,000多种蛋白。” Seer探索研究和技术开发高级总监Daniel Hornburg博士说,“我们在实验室中及与布鲁克的合作中看到了timsTOF Pro和timsTOF SCP的出色性能。timsTOF Pro和SCP与我们的Proteograph的组合,能够将血浆蛋白质组学的检测灵敏度提升到一个新的高度。”

  3、与PreOmics就组织蛋白质组学的新型BeatBox™技术扩展合作伙伴关系

  为了证明新的BeatBox系统在高通量组织匀浆方面的性能,PreOmics在BeatBox上处理了各种组织样本,并将结果与使用其他商业性匀浆解决方案的结果进行了对比。使用 iST 蛋白质组学样品制备法处理来自组织样品的蛋白质提取物,并在timsTOF Pro上使用DDA-PASEF采集数据,采集时间只需45分钟。从组织样本处理到获取高质量蛋白质组数据,整套BeatBox-timsTOF工作流程不到4小时,并且可以在10分钟内对96个组织样本进行匀浆处理。与其他组织匀浆解决方案相比,BeatBox技术具有最高的蛋白质检测量,最高可增加3倍,并且在不同组织中都展现非常好的重现性。BeatBox-timsTOF Pro工作流程实现了出色的蛋白质组学的覆盖范围,比如小鼠肺组织可检测大于4,000个蛋白,小鼠心肌组织则可检测2300个蛋白。

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图2:Easy to use, fast tissue homogenization for efficient and reproducible sample preparation.

  PreOmics创始人兼董事总经理Nils A Kulak博士和Garwin Pichler博士评论道:“我们对高效、可重复的蛋白质组学组织匀浆的BeatBox 技术感到非常兴奋。BeatBox与PreOmics的蛋白质组学样品制备技术无缝兼容。与timsTOF Pro相结合,为大型组织生物样本库的样品处理提供了一站式的工作流程。”

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