目前已有使用整体柱，纳米纤维以及膜吸附替代传统的填料颗粒的方案。对流装置的一个明显优势在于其独立性和对流量的控制能力，传质不像传统层析柱受到孔隙扩散的限制。薄膜扩散比孔隙扩散快的多，分离仅受到每个分子结合动力学差异（生物分子和固定相之间的亲和力）的影响。但是也因为比表面积的减少，膜结合蛋白的能力比层析柱差很多（CIM-protein A monolith的载量是7.2 mg/mL，MabSelectSuRe LX 和Toyopearl AF-rProtein A的载量是100 mg/mL），但不影响对核酸、病毒和细胞的结合能力。目前工业上，膜类材质广泛应用于初级纯化和精纯阶段。另外将不同类型的纳米颗粒（带电的、中性的、磁性的）整合到膜结构中，可实现提高分辨率的效果。

　　其他吸附剂，例如磁珠，也可用于蛋白的分离过程，但是目前在大规模生产上的应用有限。不过在双水相体系（ATPS）具有良好的应用前景。