三种光合磷酸化作用都与电子传递相偶联。如果在叶绿体体系中加入电子传递抑制剂，那么光合磷酸化就会停止；同样，在偶联磷酸化时，电子传递则会加快，所以在体系中加入磷酸化底物会促进电子的传递和氧的释放。

磷酸化和电子传递的关系可用ATP/e2-或P/O来表示。ATP/e2-表示每对电子通过光合电子传递链而形成的ATP分子数；P/O表示光反应中每释放1个氧原子所能形成的ATP分子数。比值越大，表示磷酸化与电子传递偶联越紧密。从图4-15或（4-27）式看,经非环式电子传递时分解2分子H2O，放1 个O2与传递2对电子，使类囊体膜腔内增加12个H+(放氧复合体处放4个H+，PQH2与Cytb6/f间的电子传递时放8个H+)，如按12个H+形成3个ATP算，即传递2对电子放1个O2，能形成3个ATP，即ATP/e2或P/O理论值应为1.5，而实测值是在0.9～1.3之间。