关于汉坦病毒的宿主基因分析

　　多采用细胞色素B基因分析方法。W.C.Black IV等采用微卫星DNA分析确定鹿鼠之间的基因关系，并研究了鼠类窝内汉坦病毒传播的方式。俄罗斯远东地区南部的7种宿主动物中存在4种汉坦病毒（HTN、PUU、SEO、KBR）。

　　L.Minskaya等的研究表明，从非主要宿主动物分离的病毒与标准株抗原性接近，但在基因分子特征上与从主要宿主动物分离的病毒不同。

　　A.Vaheri等的研究表明，西伯利亚旅鼠分离的TOP病毒与东方田鼠分离的KBR病毒S片段同源性核苷酸水平为82%，氨基酸水平为96%；与欧洲棕背分离的PUU病毒S片段同源性核苷酸水平为77%，氨基酸水平为87%。系统发生分析显示3种病毒具有共同的起源，与相应宿主动物细胞色素B基因系统发生分析结果相一致，表明3种病毒进化过程中有在宿主动物之间进行的水平传播。其中TOP病毒M、S片段3’-NCR最长，可能在3种汉坦病毒中起源最早。

　　J.W.Song等报告韩国姬鼠来源的不同HTN病毒株，M基因324bp片段同源性95%～99%，姬鼠细胞色素B基因424bp和线粒体DNA D-环区序列差异性0%～3.1%，表明韩国不同地区姬鼠有相同的基因背景，HTN病毒具有相同的来源，在韩国没有发现HTN病毒株与其宿主动物共同发生较大变异的现象。

　　Heiske A.等进行的系统发生分析表明，欧洲西部PUU病毒与瑞典、芬兰、俄罗斯的PUU病毒不同，同一分枝PUU病毒S片段开放读码框架基因差异性小于8%，不同分枝PUU病毒S片段开放读码框架基因差异大于14%。同一分枝PUU病毒核蛋白氨基酸序列差异0%～2%，不同分枝PUU病毒核蛋白氨基酸序列差异3%～5%。有资料表明，不同地区的欧洲棕背可以分为几个亚类，这一研究支持了PUU病毒与其宿主动物共演化的观点。

　　L.Ivanov等对来源于俄罗斯远东地区东方田鼠的KBR病毒进行研究，结果表明不同KRB病毒株间存在0.5%～4.0%的基因差异，基因差异与捕鼠地区的关系大于与捕鼠年份的关系，表明KBR病毒与东方田鼠之间存在长期的共演化过程。