华南农业大学发现穿山甲为新型冠状病毒潜在中间宿主
2019年12月以来，湖北省武汉市集中发生了不明原因肺炎疫情。流行病调查发现这些陆续出现的肺炎病例都与武汉市“华南海鲜市场”有关联。武汉市组织多学科专家会诊调查，利用实验检测等手段认定武汉地区肺炎疫情为病毒性肺炎。2020年1月8日，初步确认了一种新型冠状病毒为此次疫情的病原。
现阶段疫情防控严峻，急需弄清新型冠状病毒的自然宿主和中间宿主！
2020年1月21日，中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员、军事医学研究院国家应急防控药物工程技术研究中心钟武研究员和中科院分子植物卓越中心合成生物学重点实验室李轩研究员合作，在SCIENCE CHINA Life Sciences（《中国科学：生命科学》英文版），在线发表了题为“Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission”的论文。该文通过公布的基因组序列推测武汉冠状病毒的自然宿主也可能是蝙蝠。
2020年2月3日，Nature杂志在线发表了两篇关于新型冠状病毒论文，它们分别是来自中国科学院武汉病毒研究所石正丽团队题为“Pneumonia outbreak is associated with a novel coronavirus of likely bat origin”的研究论文；和来自复旦大学公共卫生学院张永振组题为“A new coronavirus associated with human respiratory disease in China”的研究论文，它们通过对病毒测序，发现新型冠状病毒2019-nCoV为病原体，同时发现nCoV-2019病毒与SARSr-CoV有高度的序列相似性；然后，做了进化树分析发现在整个基因组水平上，nCoV-2019与蝙蝠冠状病毒的同源性为96％，证实了蝙蝠可能是该新型冠状病毒的自然宿主（点击查看）。
1月24日，国家卫健委高级别专家组证实：新型冠状病毒不仅在感染的人体内被检测到，在华南海鲜市场非法销售野生动物的摊位也分离了出来，提示新型冠状病毒来自野生动物。
然而，至今为止，我们仍然不知新型冠状病毒的中间宿主是什么野生动物，它是如何被蝙蝠感染，又如何跨物种传到人身上的？
2020年1月22日，在Journal of medical virology杂志上发表了题为“Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human”的研究论文。该研究通过与其他动物相比，基于蛇的RSCU偏差类似，表明蛇是造成当前2019-nCoV感染爆发的中间宿主（点击查看）。
但是该结论遭到了多数专业人士的不认可，文章的分析方法有问题，因为这个同义密码子使用偏向分析并不适合用来研究冠状病毒的宿主，故文章结论不靠谱（点击查看）。
此外，2020年1月25日，北京大学朱怀球及浙江大学肖永红共同通讯在bioRxiv 在线发表题为“Host and infectivity prediction of Wuhan 2019 novel coronavirus using deep learning algorithm”的研究论文，该研究预测表明，与感染其他脊椎动物的冠状病毒相比，蝙蝠冠状病毒被赋予2019-nCoV相似的感染模式。此外，通过比较脊椎动物宿主的所有病毒的感染模式，研究人员发现水貂病毒显示出与2019-nCov更为接近的感染模式。传染性模式分析的这些结果表明，水貂可能是2019-nCov的中间宿主。
2020年2月6日，据华南农业大学官方报道：华南农业大学、岭南现代农业科学与技术广东省实验室沈永义教授、肖立华教授等科研人员联合中国人民解放军军事科学院军事医学研究院杨瑞馥研究员及广州动物园科研部陈武高级兽医师开展的最新研究表明，穿山甲为新型冠状病毒潜在中间宿主。这一最新发现将对新型冠状病毒的源头防控具有重大意义。
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