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cDNA文库组标准流程-6

2020.9.07

2.pBlueScriptII的双酶切消化
1.以如下体系进行EcoRI酶切:
pBSK(+) X µl(6µg)
ddH2O 174-X µl
10×Buffer E 20 µl
混匀,加入限制性内切酶:
EcoRI (10U/ µl) 6 µl
总体积为200 µl。
2.轻弹管壁或用枪头轻轻吹打混匀,在离心机上甩一下。
3.37℃,水浴1hr。
4.加入200ul 1:1的酚/氯仿,混匀。4℃,13000rpm,离心15min。
5.取上清,加入等体积的氯仿,4℃,13000rpm,离心10min。
6.取上清,加入0.1倍体积的NaAC和2.5倍体积的无水乙醇,-20℃,沉淀30min。
7. 4℃,13000rpm,离心10min,弃上清,取沉淀。
8.加入200ul 70%的乙醇洗沉淀。
9.4℃,13000rpm,离心10min,弃上清,取沉淀。
10.自然风干沉淀,至无乙醇味,加入100ul ddH2O充分溶解沉淀。
11.加入以下试剂进行XhoI酶切:
ddH2O 74 µl
10×Buffer D 20 µl
混匀,加入限制性内切酶XhoI:
XhoI (10U/ µl) 6 µl
总体积为200 µl。
12.轻弹管壁或用枪头轻轻吹打混匀,在离心机上甩一下
13.37℃,水浴1.5hr。
14.加入200ul 1:1的酚/氯仿,混匀。
15.4℃,13000rpm,离心15min。
16.取上清,加入等体积的氯仿,4℃,13000rpm,离心10min。
17.取上清,加入0.1倍体积的NaAC和2.5倍体积的无水乙醇,-20℃,沉淀 30min。
18. 4℃,13000rpm,离心10min,弃上清,取沉淀。
19.加入200ul 70%的乙醇洗沉淀。
20.4℃,13000rpm,离心10min,弃上清,取沉淀。
21.自然风干沉淀至无乙醇味,加入40ulddH2O充分溶解沉淀,得到双酶切载体。
3.载体去磷酸化
1.在40ul双酶切载体中加入以下试剂:
6ul 10×buffer
6ul CIAP(0.01U/ul)
8ul ddH2O
总体积60ul。
2.轻弹管壁或用枪头轻轻吹打混匀,在离心机上甩一下。
3.37℃,水浴1hr。
4.70℃,15min,灭活酶。
5.电泳分离,胶回收双酶切载体,定量。
4.载体效率检测 1.按以下所示作4 个连接反应:


DNA



1

pBlueScriptII/E/X /CIAP

-

检测酶切效率

2

pBlueScriptII/E/X /CIAP

+

检测脱磷效率,载体自连效率

3

商品Vector加标准Insert

+

对照

4

自制Vector加标准Insert

+

检测载体效率


14℃连接过夜。
1.各取1ul连接产物作电转化(具体流程见电转化)
2.计算克隆数,计算载体相对脱磷效率及连接效率。 五.cDNA双链和载体的连接:
1.连接:
根据载体和cDNA的电泳定量结果,每个样品设置3个比例的连接,
即:insert/vector=1/3 incert /vector=1/1 insert/vector=3/1
按以下体系依次加入:

14℃,连接过夜  


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