近期专家及民众对2019-新型冠状病毒核酸阳性检出率低、咽拭子屡次阴性、核酸检测与临床诊断不吻合等问题提出各种观点或疑惑。回顾近三年我们对呼吸道感染患儿不同取材部位多种呼吸道病原体检出率的研究，供大家参考，希望对2019-新型冠状病毒核酸检测有所指导，对临床医生选择采样位置以及解读结果有所启示，对民众理解疾病诊治和防控有所帮助。

1、痰样本检出病原体种类显著高于咽拭子[1]

我们在2018年1-7月对1-13岁440例下呼吸道感染住院患儿，采集抽吸痰（下呼吸道部位）与口咽拭子（上呼吸道）配对样本（采集时间间隔小于1小时），使用多重PCR技术检测11种常见呼吸道病原体核酸（甲流、乙流、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、腺病毒、偏肺病毒、博卡病毒、冠状病毒[含229E、OC43、NL63、HKU1]、肺炎支原体和衣原体），比较两种类型样本检出差异。

结果显示痰样本11种病原体总体阳性率略高于咽拭子（88%vs. 84%），大部分呼吸道病毒在两种标本中阳性率一致，而痰样本中支原体阳性率显著高于其配对咽拭子（100%vs. 45%）。在检出结果不一致的配对样本，痰样本中检出病原体类型显著多于咽拭子样本病原体类型（16.1vs. 3.6%）。研究提示下呼吸道感染患儿痰样本检出病原体种类高于咽拭子。

2、难治性肺炎支原体肺炎患儿病原体检出率与病程有一定关系[2]

对接受纤维支气管镜灌洗治疗的难治性肺炎支原体肺炎（RMPP）患儿采用多重PCR、荧光定量PCR技术和被动凝集法分别检测痰、肺泡灌洗液核酸以及血清肺炎支原体抗体。我们发现荧光定量PCR检测肺泡灌洗液病原体阳性率与病程显著相关，即随着病程进展，荧光定量PCR检测肺泡灌洗液核酸持续阳性，而痰核酸阳性率、抗体阳性率与病程长短不相关。提示临床对于存在肺部大面积损伤且常规大环内酯类抗生素治疗7天仍未好转的患者，外周血抗体转阴、痰样本核酸转阴时，仍应关注肺泡灌洗液内的病原体核酸检测结果。

2020年2月11日，深圳病原与免疫重点实验室等单位[3]联合研究“评价不同呼吸道标本在2019-冠状病毒感染实验室诊断和病毒脱落监测中的准确性”，发现在发病后的第一个14d，除支气管肺泡灌洗液(BALF)外，痰标本阳性率最高(74.4%~88.9%)，其次为鼻拭子(53.6%~73.3%)；在发病后的第15d，痰和鼻拭子仍有较高的阳性率（42.9%~61.1%）；发病后8d采集的咽拭子阳性率较低，轻型病例咽拭子阳性率较低；重症患者下呼吸道均可检测到病毒RNA，轻度患者未检测到病毒RNA；BALF中病毒RNA的检测对于严重病例的病毒诊断和监测是必要的。

由此可见，病原体核酸检测应充分考虑采集不同的样本类型、采集部位、采集时期、病程及疾病严重程度。

因新型冠状病毒传染性强，不适合做大样本临床观察及实验，希望我们既往对病原体核酸检测对比研究结果能为新型冠状病毒感染的诊断与防控提供参考。

【参考文献】
1.Comparing the yield of oropharyngeal swabs and sputum for detectionof 11 common pathogens in hospitalized children with lowerrespiratory tract infection
2．《3种方法检测儿童肺炎支原体感染的临床评估》
3．Evaluatingthe accuracy of different respiratory specimens in the laboratorydiagnosis and monitoring the viral shedding of 2019-nCoV infections