中国科学家9月参与发表多篇Nature文章
9月中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表，其中包括首次揭示m6A甲基化修饰的新作用，表观遗传调控核心复合物PRC2招募到基因组上重要位点的分子机制，以及兰花基因关键演化机制。
来自中科院动物研究所，北京基因组研究所的研究人员通过m6A测序技术（m6A-Seq），首次揭示m6A甲基化修饰在造血干细胞发育中的关键作用，是该研究领域的重大科研突破。
研究人员通过m6A测序技术（m6A-Seq）发现，缺失m6A甲基转移酶mettl3后，m6A在胚胎发育相关mRNA中的富集程度显著下降。同时，在斑马鱼的血液-血管系统中，可检测到mettl3的特异性表达。由此推测，m6A修饰与血液发育过程密切相关。
系统的表型检测显示，在mettl3缺失的胚胎中，造血干细胞不能正常产生，血管的内皮特性却明显增强，内皮-造血转化过程受到阻断。m6A-Seq和RNA-Seq综合分析发现，在mettl3缺失的胚胎中，一系列动脉内皮发育相关的基因，尤其是notch1a的m6A修饰水平显著降低，而其mRNA水平却显著升高。
上述结果证明，m6A修饰与EHT过程中内皮和造血基因表达的平衡调控相关。此外，YTHDF2-RIP-Seq和单碱基分辨率的m6A-miCLIP-Seq发现，m6A通过YTHDF2介导notch1a mRNA的稳定性，以维持EHT过程中内皮细胞和造血细胞基因表达的平衡，进而调控造血干细胞的命运决定。上述结果在小鼠中也得到了验证，证明m6A对造血干细胞命运决定的调控在脊椎动物中是保守的。
北京师范大学生命科学学院的王占新教授首次发现PCL家族蛋白的EH结构域识别含有非甲基化CpG序列的DNA元件，揭示了表观遗传调控核心复合物PRC2招募到基因组上重要位点的分子机制，为进一步理解PCL家族蛋白在PRC2复合物中的生理功能，以及靶向与PRC2相关疾病开辟了一个全新的思路。
这项研究首次发现并证实了PCL家族蛋白是连接PRC2与CpG岛的纽带，该工作为PRC2复合物在染色质上CpG岛特异的招募提供了直接的实验证据，解决了困惑人们多年的关于PRC2在染色质上选择性定位的这一重要问题，为进一步理解PCL家族蛋白在PRC2复合物中的生理功能，以及靶向与PRC2相关疾病开辟了一个全新的思路。
此外，由国家兰科植物种质资源保护中心/深圳市兰科植物保护研究中心，比利时根特大学，日本埼玉大学等处组成的研究小组发表了题为“The Apostasia genome and the evolution of orchids”的文章，利用PacBio，Illumina，以及10X Genomics的最新技术，全新解析了一种兰花的基因组序列，这将有助于科学家们深入了解兰花的进化以及适应机制。
在这篇文章中，研究人员首先从深圳拟兰叶，茎和花的样本中分离出基因组DNA，然后分别利用Illumina HiSeq 2000和PacBio RS测序仪获得了短读长和长读长序列，将其组合在一起，再加上10X Genomics生成的scaffold数，完成了深圳拟兰的基因组草图，填补了空白。同时研究人员还利用新的转录组序列，进行比较基因组学和系统发育分析，进一步了解兰花品种之间的亲缘关系，以及进化兰花特征。
“我们发现了新的基因家族，新扩增或减少的基因家族，还有MADS-box基因类别中出现的变化（调控兰花进化过程中多个发育阶段）。这项工作揭示了兰花进化进程中的关键遗传事件，”作者写道。
