随着联用技术的日趋完善，HPLC-MS逐渐成为最热门的分析手段之一。特别是在分子水平上可以进行 蛋白质、 多肽、核酸的分子量确认，氨基酸和 碱基对的序列测定及翻译后的修饰工作等，这在HPLC-MS联用之前都是难以实现的。HPLC-MS作为已经比较成熟的技术，目前己在生化分析、 天然产物分析、药物和保健食品分析以及 环境污染物分析等许多领域得到了广泛的应用。

　　1 生化方面的分析中的应用

　　生物体内的蛋白质、肽和核酸，都以混合物状态出现，具有强 极性，难挥发性，又具有明显的热不稳定性，所以用GC-MS来分析 生物大分子存在困难，需要经过深度降解，并需对降解生物作各种复杂的衍生化处理。而HPLC能分析强极性、不易挥发、高分子量及对热不稳定的化合物；MS具有高灵敏度，能在复杂 基质中进行准确的化合物的优点，所以HPLC-MS作为生化分析的一个有力工具，正在得到日益的重视。研究人员利用HPLC-MS技术在生化方面己经有很多应用。