植物的病菌形态是复杂的，而且少数的病原菌会受环境等条件的影响。近20年来,现代分子生物学技术在植物病原菌的研究上取得了突破性进展,一些分类地位不明确、亲缘关系不清楚的物种通过该技术得到了验证,为不同病原菌的分类、鉴定和诊断提供了更丰富、更可靠的手段。植物病害检测仪能够快速的对相关病菌进行有效的测定研究，为防治提供帮助。

近年来,随着分子生物学技术在生物系统发育研究等领域的广泛应用,以PCR为基础的各种分子生物学技术在植物病原菌检测鉴定方面的应用研究报道日益增多。

在植物病原真菌的研究应用上,利用PCR-RFLP方法对捕食线虫真菌节丛孢属进行了系统发育研究,基本体现了属内不同种间的亲缘关系,从分子水平证明了节丛孢属形态分类上的合理性,同时对该属属征的扩大提出疑义;采用PCR扩增了棉花疫病菌、辣椒疫病菌核糖体基因的ITS区域,并对产物进行了克隆和序列比较;Cooke等测定了16种疫霉菌核糖体基因的ITS序列,发现不同疫霉种间变异丰富,而同种的不同菌株间则序列高度保守,并根据ITS的序列分析,提出了疫霉属卵菌的系统发育趋势。

总之,通过植物病害检测仪对核糖体基因ITS区在各种植物病害诊断中的应用愈来愈广泛,根据rDNAITS的序列差异鉴定各种植物病原菌,为植物病害的早期、快速诊断提供可靠的依据,为今后进行分类鉴定,分子流行病学调查等更深入的研究工作奠定基础,同时对植物病害的防治具有重要的意义,还可进一步进行作物病害抗源鉴定,辅助作物抗病育种。