使用miRNA的芯片及定量PCR数据研究超急性期脑梗死（HACI）的新颖标志物循环血miR-16

研究背景

全世界范围内，卒中严重降低其患病者的生存质量。而缺血性卒中占整个卒中的70-85%。快速诊断对超急性期脑梗死的临床决策非常重要。人们逐渐把寻找生物标志物的方向投向循环血的miRNA。但脑梗死病因复杂，分类繁多，使寻找特异性和敏感性高的循环血miRNA标志物困难重重。本研究使用miRNA的芯片及定量PCR数据来判定miRNA对超急性期脑梗死（HACI）的诊断价值，以TOAST及OCSP分型来探讨血浆的miRNA与脑梗死分型的关系，以MRS评分来摸索血浆的miRNA与脑梗死预后的关系。

研究思路 

研究结果

1、 HACI与健康对照组（HVT）之间的芯片差异谱

以改变倍数大于2，p小于0.05的miRNA作为差异基因。11个miRNA是上调的 (miR-140,miR-106b,miR-130a,miR-16,miR-223,miR-93,miR-484,miR-25,miR-130b ,miR-107,andmiR-151)，一个miRNA是下调的(miR-4454)。在芯片的聚类热图中本研究选送的4个对照标本自动聚拢为一个组，说明选送标本代表性良好。该研究中Agilent Human miRNA (8_60K) V19.0 array服务由伯豪生物提供。

2、以定量PCR验证芯片差异表达谱

研究者从芯片差异表达谱的12个miRNA中挑选标准化信号值较高的7个进行定量PCR验证。7个miRNA在定量PCR中的变化趋势有6个与芯片变化趋势相同，一个与芯片相反，说明二者较好的一致性。比较7个miRNA的定量PCR结果仅miR-16有统计差异。

3、基于miR-16的预测靶基因进行生物信息学分析

差异最显著的GO类别（生物学进程）主要包括细胞分化，细胞死亡，发育过程，凋亡，细胞增殖，细胞周期等。KEGG类别包含的主要经典信号通路有：p53，T细胞受体，ErbB，Toll-样受体(TLR)，NOD-样受体，MAPK。